Structural insights into 14-3-3 dependent regulation of ubiquitin ligase Nedd4-2
| Název práce v češtině: | Strukturní náhled na regulaci ubikvitin ligázy Nedd4-2 prostřednictvím proteinu 14-3-3 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Structural insights into 14-3-3 dependent regulation of ubiquitin ligase Nedd4-2 |
| Klíčová slova: | Nedd4-2, 14-3-3 protein, vápník, interakce proteinů |
| Klíčová slova anglicky: | Nedd4-2, 14-3-3 protein, calcium, protein interactions |
| Akademický rok vypsání: | 2022/2023 |
| Typ práce: | diplomová práce |
| Jazyk práce: | angličtina |
| Ústav: | Katedra fyzikální a makromol. chemie (31-260) |
| Vedoucí / školitel: | RNDr. Veronika Obšilová, Ph.D. |
| Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
| Datum přihlášení: | 31.05.2023 |
| Datum zadání: | 31.05.2023 |
| Datum potvrzení stud. oddělením: | 01.06.2023 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 01.05.2024 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 11.06.2024 |
| Oponenti: | Mgr. et Mgr. Evžen Bouřa, Ph.D. |
| Konzultanti: | prof. RNDr. Tomáš Obšil, Ph.D. |
| Předběžná náplň práce |
| 1. Exprese a purifikace Nedd4-2 a 14-3-3η. 2. Charakterizace chování Nedd4-2 a komplexu Nedd4-2:14-3-3η v roztoku pomocí maloúhlového rozptylu rentgenového záření. 3. Zkoumání vlivu Ca2+ na Nedd4-2 a komplexu Nedd4-2:14-3-3η pomocí maloúhlového rozptylu rentgenového záření a vodíko-deuteriové výměny spojené s hmotnostní spektrometrií. 4. Strukturní modelování komplexu Nedd4-2:14-3-3η na základě dat z maloúhlového rozptylu rentgenového záření. 5. Porovnání vlastností roztoku Nedd4-2 a fosforylovaného Nedd4-2 s ohledem na vliv Ca2+ a oligomerizaci pomocí analytické ultracentrifugace. |
| Předběžná náplň práce v anglickém jazyce |
| 1. Expression and purification of Nedd4-2 and 14-3-3η. 2. Characterization of the solution behavior of Nedd4-2 and Nedd4-2:14-3-3η complex with small-angle x-ray scattering 3. Investigation of the effect of Ca2+ on the Nedd4-2 and Nedd4-2:14-3-3η complex with small-angle x-ray scattering and hydrogen-deuterium exchange coupled to mass spectrometry. 4. Structural modeling of the Nedd4-2:14-3-3η complex from small-angle x-ray scattering data 5. Comparison of the solution behavior of the Nedd4-2 and phosphorylated Nedd4-2 with respect to the effect of Ca2+ and oligomerization using analytical ultracentrifugation |