Hammond M, Zoltner M, Garrigan J, Butterfield E, Varga V, Lukeš J, Field MC. The distinctive flagellar proteome of Euglena gracilis illuminates the complexities of protistan flagella adaptation. New Phytol. 2021 Nov;232(3):1323-1336. doi: 10.1111/nph.17638. Epub 2021 Aug 16. PMID: 34292600. Noselli G, Beran A, Arroyo M, DeSimone A. Swimming Euglena respond to confinement with a behavioral change enabling effective crawling. Nat Phys. 2019 May 10;15(5):496-502. doi: 10.1038/s41567-019-0425-8. Epub 2019 Feb 18. PMID: 31110555; PMCID: PMC6522345.
Předběžná náplň práce
Euglena gracilis má na svém povrchu strukturovanou pelikulu schopnou kontraktilního pohybu. Princip tohoto pohybu není znám a rádi bychom jeho mechanismu porozuměli. V tuto chvíli známe velmi hrubě proteinové složení této struktury a podařilo se nám experimentálně vyloučit možnost, že za kontrakcemi jsou zodpovědné centriny. Z dostupných dat víme, že pelikula obsahuje další potenciální molekulární motory z rodiny dyneinů. Cílem této diplomové práce bude pro vybraný motor připravit metodou CRISPR-Cas9 in situ značené verzi určit jeho lokalizaci v buňce a interakční partnery. Dále downregulovat jeho expresi pomocí RNAi a charakterizovat vzniklý fenotyp buněk.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
Euglena gracilis has a structured pellicle on its surface capable of contractile movement. The principle of this movement is unknown and we would like to understand its mechanism. At the moment, we know very roughly the protein composition of this structure and we have been able to exclude experimentally the possibility that centrin is responsible for the contraction. From the available data, we know that the pellicle contains other potential molecular motors from the dynein family. The aim of this thesis will be to prepare CRISPR-Cas9 in situ labeled versions for the selected motor to determine its localization in the cell and interaction partners. Furthermore, to downregulate its expression by RNAi and characterize the resulting cell phenotype.
