Analýza lokalizace a dynamiky komponent komplexu ARP2/3 v peroxisomech pomocí mikroskopických metod

• Název práce v češtině: Analýza lokalizace a dynamiky komponent komplexu ARP2/3 v peroxisomech pomocí mikroskopických metod
• Název v anglickém jazyce: Microscopy analysis of localization and dynamics of ARP2/3 components in peroxisomes
• Klíčová slova: ARP2/3, ARPC5, peroxisom, PEX10, PTS1, superrezoluce, fixace, vývoj rostlin, Arabidopsis, BY-2
• Klíčová slova anglicky: ARP2/3, ARPC5, peroxisome, PEX10, PTS1, superresolution, fixation, plant development, Arabidopsis, BY-2
• Akademický rok vypsání: 2021/2022
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra experimentální biologie rostlin (31-130)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Kateřina Schwarzerová, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 15.10.2021
• Datum zadání: 15.10.2021
• Datum potvrzení stud. oddělením: 15.10.2021
• Datum odevzdání elektronické podoby: 08.08.2024
• Datum proběhlé obhajoby: 04.09.2024
• Oponenti: Mgr. Eva Dvořák Tomaštíková, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Během řešení předchozích výzkumných projektů v naší laboratoři jsme zjistili, že komponenty nukleačního mechanismu aktinu, ARP2/3, jsou lokalizovány s rostlinnými peroxisomy. Cílem této DP je prokázat, zda komponenty ARP2/3 jsou lokalizovány vně nebo uvnitř peroxisomů, jak s ARP2/3 kompartmentem souvisí lokalizace dalších proteinů fungujících v udržování a degradace peroxisomů. Zkoumán bude též vliv ztráty funkčního nukleačního mechanismu aktinu na funkci a strukturu peroxisomů. Metody: exprese markerů translačně fúzovaných s fluorescenčními proteiny, mikroskopická analýza kolokalizace, biochemická analýza interakce. Superresoluční mikroskopie peroxisomů a asociovaných proteinů.