Role of TCTP1 in plant reproduction
Název práce v češtině: | Úloha TCTP1 v pohlavním rozmnožování rostlin |
---|---|
Název v anglickém jazyce: | Role of TCTP1 in plant reproduction |
Klíčová slova: | TCTP, pyl, samčí gametofyt, pylová láčka, dimerizace, rekombinantní exprese proteinů, huseníček rolní, Arabidopsis thaliana |
Klíčová slova anglicky: | TCTP, pollen, male gametophyte, pollen tube, dimerization, recombinant protein expression, Arabidopsis thaliana |
Akademický rok vypsání: | 2020/2021 |
Typ práce: | diplomová práce |
Jazyk práce: | angličtina |
Ústav: | Katedra experimentální biologie rostlin (31-130) |
Vedoucí / školitel: | Said Hafidh |
Řešitel: | skrytý![]() |
Datum přihlášení: | 13.11.2020 |
Datum zadání: | 13.11.2020 |
Datum odevzdání elektronické podoby: | 10.08.2022 |
Datum proběhlé obhajoby: | 12.09.2022 |
Oponenti: | doc. Clément Lafon Placette, Dr. |
Konzultanti: | prof. RNDr. David Honys, Ph.D. |
Seznam odborné literatury |
Berkowitz O, Jost R, Pollmann S, Masle J (2008) Characterization of TCTP, the Translationally Controlled Tumor Protein, from Arabidopsis thaliana. Plant Cell 20: 3430-3447 Branco R, Masle J (2019) Systemic signalling through translationally controlled tumour protein controls lateral root formation in Arabidopsis. Journal of Experimental Botany 70: 3927–3940 Brioudes F, Thierry A-M, Chambrier P, Mollereau B, Bendahmane M (2010) Translationally controlled tumor protein is a conserved mitotic growth integrator in animals and plants. Proc Natl Acad Sci USA 107: 16384-16389 Hafidh S, Potěšil D, Fíla J, Čapková V, Zdráhal Z, Honys D (2016) Quantitative proteomics of the tobacco pollen tube secretome identifies novel pollen tube guidance proteins important for fertilization. Genome Biol 17: 81 Kim Y-M, Han Y-J, Hwang O-J, Lee S-S, Shin A-Y, Kim SY, Kim J-I (2012) Overexpression of Arabidopsis translationally controlled tumor protein gene AtTCTP enhances drought tolerance with rapid ABA-induced stomatal closure. Mol Cells 33: 617–626 |
Předběžná náplň práce |
TCTP je eukaryotický protein s konzervovanou funkcí v regulaci buněčného růstu a buněčného cyklu. Genom huseníčku rolního (Arabidopsis thaliana) nese dva paralogy TCTP – AtTCTP1 a AtTCTP2. TCTP1 se účastní různorodých procesů, například uzavírání průduchů, iniciace postranních kořenů a potenciálně růstu pylové láčky. Fenotyp pylové láčky nebyl v naší laboratoři potvrzen, neprokázala se účast TCTP1 v růstu pylové láčky. Zato se ukázalo, že TCTP1 je esenciální v navádění pylové láčky k zárodečnému vaku. Tato diplomová práce se bude úlohou TCTP1 v reprodukčním vývoji dále zabývat, se speciálním zřetelem na interaktom TCTP1-BRL2. Budou použity metody klonování (Gateway, In-Fusion, Goldenbraid), heterologické proteinové exprese v E.coli a kvasinke, fosfopeptidového obohacení a in vitro kinázové eseje, fluorescenční mikroskopie, CRISPR-Cas9 sprostředkované mutageneze a genetické analýzy. |
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce |
Translationally controlled tumor protein (TCTP) is a well conserved multifunctional eukaryotic protein with function in cell growth and cell cycle regulation (Brioudes et al., 2010). Arabidopsis thaliana possess two TCTPparalogs – AtTCTP1 and AtTCTP2 (Berkowitz et al., 2008). TCTP1 is involved in processes as diverse as stomatal closure, lateral root initiation and potentially in pollen tube growth (Kim et al., 2012; Branco and Masle, 2019; Berkowitz et al., 2008). Interestingly, the pollen tube growth phenotype was not replicated in our laboratory, instead, TCTP1 was shown not to influence pollen tube growth but to be essential in pollen tube guidance (Hafidh et al., 2016). This diploma thesis aims to explore further the role of TCTP1 in reproductive development, with special focus on TCTP1-BRL2 interactome and downstream phosphorylation substrates. Following methods will be used – cloning (Gateway, In-Fusion and Goldenbraid), heterologous protein expression in E. coli and yeast, phosphopeptide enrichment and in vitro kinase assay, fluorescence microscopy, CRISPR-Cas9 mediated mutagenesis and genetic analysis. |