Polyglutamylation as a Posttranslational Tubulin Modification

• Název práce v češtině: Polyglutamylace jako posttranslační modifikace tubulinu
• Název v anglickém jazyce: Polyglutamylation as a Posttranslational Tubulin Modification
• Klíčová slova: α-tubulin, TTLL11, polyglutamylace, tyrozinace tubulinu, detyrozinace tubulinu, Δ3 tubulin
• Klíčová slova anglicky: α-tubulin, TTLL11, polyglutamylation, tubulin tyrosination, tubulin detyrosination, Δ3 tubulin
• Akademický rok vypsání: 2020/2021
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Cyril Bařinka, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 19.10.2020
• Datum zadání: 11.01.2021
• Datum odevzdání elektronické podoby: 08.08.2022
• Datum proběhlé obhajoby: 19.09.2022
• Oponenti: doc. RNDr. Pavel Dráber

Předběžná náplň práce

Post-translační modifikace tubulinu, jako například polyglutamylace nebo acetylace jsou součástí tzv. tubulinového kódu a propůjčují mikrotubulům rozdílné vlastnosti nutné k plnění různých fyziologických funkcí. Diplomová práce bude zaměřena na biochemickou a biofyzikální charakterizaci enzymů z rodiny TTLL (tubulin tyrosine ligase-like) odpovědných za polyglutamylaci tubulinu. Projekt zahrnuje klonování, mutagenezi, expresi a purifikaci zmíněných proteinů ve vhodných heterologních systémech, jakož i přípravu stabilních buněčných linií exprimujících jednotlivé zástupce rodiny TTLL a následnou izolaci specificky modifikovaných izoforem tubulinu. Purifikované proteiny budou použity ke studiu enzymatických charakteristik a interakcí s tubulinem (TIRF mikroskopie, termoforéza, biochemická stanovení).