Sources, identification and removal of ChIP-seq artifacts

• Název práce v češtině: Zdroje, identifikace a odstranění arteficielních signálů v metodě ChIP-seq
• Název v anglickém jazyce: Sources, identification and removal of ChIP-seq artifacts
• Klíčová slova: ChIP-seq, chromatinová imunoprecipitace, next generation sequencing, kontrola kvality, filtrování dat
• Klíčová slova anglicky: ChIP-seq, chromatin imunoprecipitation, quality control, data filtration
• Akademický rok vypsání: 2019/2020
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Martin Převorovský, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 20.02.2020
• Datum zadání: 20.02.2020
• Datum odevzdání elektronické podoby: 13.08.2021
• Datum proběhlé obhajoby: 14.09.2021
• Oponenti: doc. RNDr. Karel Fišer, Ph.D.

Předběžná náplň práce

ChIP-seq je metoda pro studium interakcí mezi proteiny a DNA v rámci celého genomu. Bakalářská práce zmapuje známé zdroje arteficielních signálů v datech z ChIP-seq a možnosti odfiltrování falešně pozitivních nálezů.