Bakteriální REP elementy

• Název práce v češtině: Bakteriální REP elementy
• Název v anglickém jazyce: Bacterial REP elements
• Akademický rok vypsání: 2020/2021
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Jaroslav Nunvář, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 09.10.2020
• Datum zadání: 09.10.2020
• Datum odevzdání elektronické podoby: 11.08.2021
• Datum proběhlé obhajoby: 06.09.2021
• Oponenti: RNDr. Jiří Zahradník, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Náplní bakalářské práce je shrnutí současného stavu poznání unikátní skupiny repetitivních elementů v genomových sekvencích bakterií, tzv. REP (Repetitive Extragenic Palindrome) elementů. Výstupem práce bude ucelený přehled o distribuci REP elementů v bakteriálních genomech, jejich evoluci (včetně asociace s mobilizujícími nukleázami RAYT) a funkcích REP elementů pro hostitelskou bakteriální buňku.
Téma je vhodné pro studenty s plánovanou specializací v bioinformatice, mikrobiologii nebo molekulární genetice. Na bakalářskou práci bude možné navázat diplomovým projektem (komplexní bioinformatická analýza evoluční dynamiky REP elementů u rodu Stenotrophomonas).