Témata prací (Výběr práce)Témata prací (Výběr práce)(verze: 368)
Detail práce
   Přihlásit přes CAS
Ubiquitin-proteasome system in studies of its inhibition and its utilization in the cell-based assay measuring viral protease activity
Název práce v češtině: Ubikvitin-proteazomální systém ve studiích jeho inhibice a jeho využití v buněčné eseji měřící aktivitu virové proteázy
Název v anglickém jazyce: Ubiquitin-proteasome system in studies of its inhibition and its utilization in the cell-based assay measuring viral protease activity
Klíčová slova: Ubikvitin-proteazomální systém, flavivirové proteázy, Zika virus, inhibice, fluorescenční proteiny
Klíčová slova anglicky: Ubiquitin-proteasome system, flaviviral proteases, Zika virus, inhibition, fluorescent proteins
Akademický rok vypsání: 2018/2019
Typ práce: diplomová práce
Jazyk práce: angličtina
Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
Vedoucí / školitel: RNDr. Taťána Majerová, Ph.D.
Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
Datum přihlášení: 12.11.2018
Datum zadání: 17.12.2018
Datum odevzdání elektronické podoby:05.06.2020
Datum proběhlé obhajoby: 10.07.2020
Oponenti: Mgr. Lukáš Čermák, Ph.D.
 
 
 
Předběžná náplň práce
Cílem práce je klonování a testování reportérů pro flavivirové proteasy pro sledování jejich aktivity v buňkách a CRISPR/Cas9 screen za účelem identifikace buněčných cílů inhibitoru proteasomu.
Experimentální práce zahrnuje přípravu konstruktů reportérové DNA pro testování aktivity flavivirových proteas v savčích buňkách a v bakteriích (návrh primerů, klonování, purifikace DNA), metody transformace a transdukce bakterií a transfekce savčích buněk a analýza buněk pomocí průtokové cytometrie, fluorescenční mikroskopie a Western blotu.
CRISPR/Cas9 screen s inhibitorem ubiquitin-proteasomového systému bude použit jako příklad identifikace specifického buněčného cíle tohoto inhibitoru.
Získané výsledky mohou být zveřejněny v našich odborných publikacích.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
The aim of this project is cloning and testing of reporters for cellular assays for flaviviral proteases and CRISPR/Cas9 konckout screen to identify cellular targets of a proteasomal inhibitor.
The experimental work involves preparation of reporter DNA constructs for cell-based and bacterial assays of flaviviral proteases (design of primers, cloning, DNA purification), methods of bacterial transformation and transduction as well as transfection of mammalian cells and analysis of cells by flow cytometry, fluorescence microscopy and Western blotting.
CRISPR/Cas9 knockout screen with an inhibitor of ubiquitin-proteasome will be used as an example of identification of a specific cellular target of this inhibitor.
Obtained results can be reported in our scientific publications.
 
Univerzita Karlova | Informační systém UK