Development of inhibitors of amyloid fibril formation

• Název práce v češtině: Vývoj inhibitorů tvorby amyloidních fibril
• Název v anglickém jazyce: Development of inhibitors of amyloid fibril formation
• Klíčová slova: alfa-synuklein; amyloid; cytotoxicita; chybné složení proteinu; inhibitor
• Klíčová slova anglicky: alpha-synuclein; amyloid; cytotoxicity; misfolding; inhibitor
• Akademický rok vypsání: 2018/2019
• Typ práce: disertační práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra biochemie (31-250)
• Vedoucí / školitel: Dmytro Yushchenko, Dr.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 15.10.2018
• Datum zadání: 17.10.2018
• Datum potvrzení stud. oddělením: 17.10.2018
• Datum odevzdání elektronické podoby: 14.12.2021
• Datum proběhlé obhajoby: 21.04.2022
• Oponenti: prof. Ing. Bohdan Schneider, CSc.

Předběžná náplň práce

Parkinsonova choroba je charakterizována chybným složením proteinu α-synukleinu a tvorbou amyloidních fibril. V současné době neexistují účinné terapeutické přístupy zaměřené na tento proces.
Výzkumný projekt Anastasiie je zaměřen na vývoj inhibitorů růstu amyloidních fibril α-synukleinu. Tento projekt kombinuje přípravu inhibitorů na bázi peptidů a proteinů se studiem jejich aktivity měřením kinetiky tvorby amyloidních fibril. Anastasiia bude ve velké míře používat molekulární klonování a racionální design proteinů. Dále bude provádět expresi proteinů, jejich funkcionalizaci, kvantifikaci vychytávání protenů v buňkách a kvantifikaci jejich fibrilizace pomocí fluorescenční spektroskopie a mikroskopie.
Kromě zkušeností s molekulární a buněčnou biologií se Anastasiia během své PhD práce naučí nejnovější techniky z oblastí chemické biologie, medicínské chemie a mikroskopie.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Parkinson's disease is characterized by misfolding of neuronal protein α-synuclein with formation of amyloid fibrils. However, currently there are no efficient therapeutic approaches targeting α-synuclein misfolding.
The research project of Anastasiia is focused on the development of inhibitors of α-synuclein amyloid fibril growth. It combines preparation of peptide- and protein-based inhibitors as well as studies of their activity by measuring the amyloid fibril formation kinetics. She will extensively use molecular cloning and protein design. She will perform protein expression, functionalization, quantification of protein uptake into cells and fibrillization by means of fluorescence spectroscopy and microscopy.
In addition to the experience in molecular and cell biology, during her PhD Anastasiia will obtain a nice opportunity to learn latest techniques from the fields of chemical biology, medicinal chemistry and microscopy.