Vývoj vybraných CD znaků a jejich role ve fylogenezi imunitního systému člověka

• Název práce v češtině: Vývoj vybraných CD znaků a jejich role ve fylogenezi imunitního systému člověka
• Název v anglickém jazyce: Development of selected CD markers and their role in the phylogenesis of human immune system
• Klíčová slova: CD znak, imunocyt, B lymfocyt, vrozená a adaptivní imunita, databáze sekvencí, aminokyselina, nukleotid
• Klíčová slova anglicky: CD marker, immunocyte, B lymphocyte, innate and adaptive immunity, sequence database, amino acid, nucleotide
• Akademický rok vypsání: 2017/2018
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Šárka Růžičková, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 30.11.2017
• Datum zadání: 30.11.2017
• Datum odevzdání elektronické podoby: 08.05.2018
• Datum proběhlé obhajoby: 01.06.2018
• Oponenti: doc. RNDr. Michal Vinkler, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Bakalářská práce bude navazovat na diplomovou práci Mgr. A. Grígelové, v níž byly identifikovány starobylé B lymfocytární populace v periferní krvi člověka nesoucí unikátní kombinaci povrchových CD znaků, pravděpodobně pocházející z doby, kdy se vyvinuly paryby. Náplní práce bude jednak práce s databázemi sekvencí vybranývch molekul na úrovni mRNA a proteinu, jmenovitě NCBI Blast, GeneBank, Gene Cards, OMIM, Homologene, OrthoDB a Panther Data. Cílem bude jednak zjistit původ a případně funkci vybraných povrchových CD znaků, v tomto případě CD19, CD20, CD21, CD24, CD27 a CD38. A dále mezidruhovým porovnáním sekvencí nukleotidů a aminokyselin prostřednictvím gene tree metody vystopovat změny, k nimž došlo na doménové úrovni a jež vedly u člověka k dnešní podobě a funkci uvedených molekul.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

The bachelor thesis will follow the diploma thesis of Mgr. A. Grígelová, in which the ancient B-cell population of the human peripheral blood carrying particular combination od CD markers was identified, presumably originating from the time when the cartilaginous fishes developed. The work will be focused on the work with sequence databases of selected molecules at the level of mRNA and protein, namely NCBI Blast, GeneBank, Gene Cards, OMIM, Homologene, OrthoDB and Panther Data. The aim will be to determine the origin and possibly the function of selected surface CD markers, in this case CD19, CD20, CD21, CD24, CD27 and CD38. In addition, inter-species comparison of nucleotide and amino acid sequences using the gene tree method to trace changes that have occurred at the domain level and have led to the present form and function of mentioned molecules in humans.