Exploring novel strategies targeting HBV

• Název práce v češtině: Nové přístupy cílené proti viru hepatitidy typu B
• Název v anglickém jazyce: Exploring novel strategies targeting HBV
• Klíčová slova: HBV, HBc, kapsidový protein, proximitní biotinylace
• Klíčová slova anglicky: HBV, HBc, core protein, proximity biotinylation
• Akademický rok vypsání: 2017/2018
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Vedoucí / školitel: Mgr. Klára Grantz Šašková, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 14.11.2017
• Datum zadání: 15.11.2017
• Datum odevzdání elektronické podoby: 10.08.2019
• Datum proběhlé obhajoby: 11.09.2019
• Oponenti: prof. RNDr. Jan Černý, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Studentka otestuje připravené DNA kontrukty kombinující kapsidový protein viru HBV s biotin ligázou, umožňující biotinylaci interagujících proteinů. Konstrukty budou následně transfekovány do savčích buněk, ve kterých bude provedena in vitro biotinylace, přečištění a následná hmotnostně-spektrometrická analýza. Potencionální hity budou validovány metodou pull-down.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Student will test prepared DNA constructs combining core protein of Hepatitis B virus with biotin ligase, enabling biotinylation of interacting proteins. Constructs will be tested in mammalian cell cultures, proteins purified and subsequently analysed by mass-spectrometry. Potential hits will be validated by pull-down method.