Introgresní zóna druhů Arabidopsis lyrata a A. arenosa ve střední Evropě

• Název práce v češtině: Introgresní zóna druhů Arabidopsis lyrata a A. arenosa ve střední Evropě
• Název v anglickém jazyce: Introgressive zone of Arabidopsis lyrata and A. arenosa in Central Europe
• Klíčová slova: Arabidopsis, Brassicaceae, Cruciferae, introgrese, polyploidie, velikost genomu, morfologie
• Klíčová slova anglicky: Arabidopsis, Brassicaceae, Cruciferae, introgression, polyploidy, genome size, morphology
• Akademický rok vypsání: 2016/2017
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra botaniky (31-120)
• Vedoucí / školitel: prof. RNDr. Karol Marhold, DrSc.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 26.11.2016
• Datum zadání: 26.11.2016
• Datum odevzdání elektronické podoby: 13.08.2018
• Datum proběhlé obhajoby: 03.09.2018
• Oponenti: RNDr. Stanislav Španiel, Ph.D.
• Konzultanti: Roswitha Elisabeth Schmickl, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Hybridizace, introgrese a polyploidizace, zejména ve vzájemných kombinacích, patří k nejdůležitějším speciačním procesům u vyšších rostlin. I když jsou základní rysy těchto procesů dobře známy, jejich konkrétní projevy se u jednotlivých skupin rostlin (nebo dokonce v konkrétních jednotlivých případech) do značné míry liší a jejich detailní studium přináší zajímavé výsledky. U rodu Arabidopsis je známo několik případů, kdy se speciace ubírala komplikovanou cestou hybridizace a polyploidizace (např. A. kamchatica, A. suecica) ale jsou známy i příklady, kde usuzujeme na introgresivní hybridizaci (např. mezi A. arenosa a A. lyrata). Cílem diplomové práce bude testování hypotézy o korelaci mezi gradientem introgrese a ekologickým gradientem mezi druhy A. arenosa a A. lyrata. Dalším aspektem práce bude testování hypotézy o nezávislém původu tetraploidních populací A. petraea ve střední Evropě. Metody, ktoré budou použity k testování těchto hypotéz budou průtoková cytometrie, multivariační morfometrika, modelování ekologických nik a sekvenování nové generase (s využitím metody RADSeq).

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Hybridisation, introgression and polyploidy, especially in their combination belong to the most important speciation processes in vascular plants. Athough basic features of these processes are generally well known, their cases in particular groups of plants and concrete cases differ a lot and their studies often bring interesting results. In the genus Arabidopsis several cases of combined hybrid and polyploid speciation are known (e.g. A. kamchatica, A. suecica) and there are also cases where we expect introgressive hybridization (e.g. between A. arenosa and A. lyrata). The aim of the diploma thesis is to test the hypothesized correlation between the gradient of introgression and the ecological gradient between A. arenosa and A. lyrata. Another major aspect of the thesis will be to test the hypothesis of independent origins of tetraploid populations of A. petraea in central Europe. The methods applied to test these hypotheses will be flow cytometry, multivariate morphometrics, ecological niche modelling and next generation sequencing (using RADSeq method).