Geny sekundárního metabolismu v půdních bakteriálních společenstvech

• Název práce v češtině: Geny sekundárního metabolismu v půdních bakteriálních společenstvech
• Název v anglickém jazyce: Gene pool of the secondary metabolism in soil bacterial communities
• Klíčová slova: Aktinobakterie; sekundární metabolismus; rezistence
• Klíčová slova anglicky: Actinobacteria; secondary metabolism; resistance
• Akademický rok vypsání: 2016/2017
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: Ing. Jan Kopecký, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 16.11.2016
• Datum zadání: 16.11.2016
• Datum odevzdání elektronické podoby: 02.01.2019
• Datum proběhlé obhajoby: 04.02.2019
• Oponenti: RNDr. Mgr. Vendula Brabcová, Ph.D.
• Konzultanti: doc. RNDr. Markéta Marečková, prom. biol., Ph.D.

Předběžná náplň práce

Vytvoření databáze sekvencí vybraných biosyntetických a rezistenčních genů
Návrh primerů pokrývajících jednotlivé skupiny genů pro amplifikaci úseků vhodných pro sekvenování a pro kvantifikaci, ověření pokryvu a selektivity in silico, odhad termodynamických parametrů
Validace navržených primerů amplifikací z chromozomálních DNA sbírkových kmenů
Validace amplifikací z environmentální DNA, klováním a sekvenováním
Použití navržených primerů v modelovém pokusu