První část práce bude věnována vyhledávání interakčních partnerů hlavního kapsidového proteinu VP1 lidského BK viru (konstrukce plazmidů umožňujících expresi VP1 fúzovaného s kotvou pro izolaci, izolace komplexů pomocí afinitní chromatografie, identifikace proteinů hmotnostní spektrometrií) a funkční studii nalezených interagujícíh partnerů (ověření pomocí imunoprecipitace, studium role proteinu v životním cyklu viru - specifické inhibitory, siRNA, knock-out linie). Druhá část práce se bude zabývat bližší charakterizací již popsané interakce hlavního kapsidového proteinu VP1 myšího polyomaviru s mikrotubuly.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
First part of work will be dedicated to screening of possible interactions partners of human BK virus major capsid protein VP1 (expression plasmids construction, protein complexes insolation using affinity chromatography, protein indentification by mass spectrometry) and verification of their functions in virus life cycle (immunoprecipitation, specific inhibitors, siRNA and knock-out lines). In second part of work, the interaction of mouse polyomavirus VP1 with microtubules will be characterised.
- zadáno vedoucím/školitelem