Dopad downregulace exprese genu pro peptidázovou podjednotku ClpP mitochondriální proteázy ClpXP na strukturu a funkci mitochondrií v lidských buňkách
Název práce v češtině:
Dopad downregulace exprese genu pro peptidázovou podjednotku ClpP mitochondriální proteázy ClpXP na strukturu a funkci mitochondrií v lidských buňkách
Název v anglickém jazyce:
Impact of downregulation of gene expression of the peptidase subunit ClpP of the mitochondrial protease ClpXP on structure and function of mitochondria in human cells
P53 je jedním z nejdůležitějších buněčný tumor supresorových faktorů. Jeho hlavní funkcí je jaderná transkripční regulace celé řady efektorových proteinů podílejících se na řízení buněčného cyklu, DNA-opravných mechanismů a programované buněčné smrti. V poslední době se ukazuje, že navíc k této na transkripci závislé aktivitě, je p53 schopen mimojaderně (cytoplazmaticky) působit i na transkripci nezávisle. Významné mimojaderné množství p53 je opakovaně nalézáno v mitochondriích. Zde je implikováno fungování p53 při pro-apoptotické signalizaci a ochaně mitochondriální DNA. V současné době jsme identifikovali mitochondriální ATPázu LACE1 jako protein, který fyzicky interaguje s mitochondriálním p53, má výrazný pro-apoptotický charakter a indukuje mitochondriální translokaci p53. Cílem navrhovaného projektu je identifikovat mechanismus LACE1-závislého mitochondriálního importu p53, identifikovat další proteiny zapojené do tohoto procesu a v neposlední řadě i přímé mitochonriální efektorové proteiny p53 vedoucí k ovlivnění mitochondriálního metabolismu, programované buněčné smrti a proteinové homeostázy. V rámci projektu bude využito metod shRNA knockdownu a CRISPR knockoutu jak na imortalizovaných tak na primárních buněčných linií, dále metod proteinové exprese, western blotu, imunoprecipitace, identifikace hmotovou spektrometrií a konfokální mikroskopie.
- zadáno vedoucím/školitelem