Epigenetic control of PU.1 gene transcription during development of 5-Azacytidine resistance in acute myeloid leukemia

• Název práce v češtině: Epigenetická regulace genu PU.1 v rezistenci na léčbu 5-azacytidinem u akutní myeloidní leukémie
• Název v anglickém jazyce: Epigenetic control of PU.1 gene transcription during development of 5-Azacytidine resistance in acute myeloid leukemia
• Klíčová slova: Myelodysplastický syndrom (MDS), akutní myeloidní leukémie (AML), azacytidin (AZA), DNA metylace, DNA hydroxymetylace, PU.1, TET
• Klíčová slova anglicky: Myelodysplastic syndrome (MDS), acute myeloid leukemia (AML), azacitidine (AZA), DNA methylation, DNA hydroxymethylation, PU.1, TET
• Akademický rok vypsání: 2015/2016
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Mgr. Pavel Burda, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 11.11.2015
• Datum zadání: 11.11.2015
• Datum odevzdání elektronické podoby: 28.04.2017
• Datum proběhlé obhajoby: 08.06.2017
• Oponenti: RNDr. Nikola Čuřík, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Hematopoéza je složitě organizovaný proces vedoucí k vývoji různých krevních elementů. Myelopoéza je produkce granulocytů, monocytů, lymfopoéza vede k tvorbě B a T lymfocytů v kostní dřeni. Regulace myelo a lymfopoézy zahrnuje vývoj z hematopoetických kmenových buněk do CMP („common myeloid progenitors“) a CLP („common lymphoid progenitors“) a jejich následnou diferenciaci do funkčních krevních buněk. PU.1 představuje klíčový transkripční faktor myelo a lymfopoézy. Porucha diferenciace je spojena se snížením exprese PU.1 (Rosenbauer 2004, Čuřík 2012). Diferenciace a zvýšení PU.1 lze dosáhnout pomocí inhibitorů DNA methylace. Gen pro PU.1 zahrnuje 5 exonů a řadu regulačních oblastí, mezi které patří oblast URE („upstream regulatory element“, v lidském genomu 17kb upstream k transkripčnímu startu). Delece URE způsobuje snížení exprese PU.1 asi na 20% a vývoj AML a poruchu v lymfopoezi (Rosenbauer 2004, 2006). Předmětem diplomové práce je epigenetický výzkum URE. Bude studována methylace DNA a modifikace histonů u vzorků ze separovaných buněčných populací získaných odběrem od pacientů s akutní leukémií. Tato práce si klade za cíl prozkoumat regulaci exprese PU.1 u AML a v normální myelopoezi.