Cílem zadané bakalářské práce je literární rešerše zaměřená na v současnosti nejpoužívanější a nejoblíbenější metodu stanovení relativní délky telomer (koncových částí chromosomů) u ptáků, tj. kvantitativní PCR (qPCR). V mnoha studiích bylo doposud prokázáno, že zkracování a relativní délka telomer souvisí s délkou života a mírou přežívání a předurčuje tak biologický věk jedinců. Analýza pomocí qPCR je relativně rychlá, přesná a univerzální metoda, avšak skýtá některá úskalí, nejzásadnější problém představuje výběr referenčních markerů (většinou genů, které se vyskytují v celém genomu pouze v jedné kopii, tzv. single copy genů). Tyto referenční markery jsou přitom zcela zásadní pro správné určení délky telomer a jejich relativního zkracování. Hlavním cílem práce tedy bude kriticky zhodnotit úskalí metody qPCR používané ve studiích zabývajících se relativní délkou a zkracováním telomer u ptáků, ale i jiných obratlovců. Nad rámec základu bakalářské práce bude mít studentka možnost vytipovat z literatury jiné vhodné single-copy geny, které by mohly být použitelné jako vhodné referenční markery pro analýzu stanovení počtu kopií v genomu (tzv. gene copy number variation analysis) a tím i pro analýzu relativní délky telomer, která slouží k odhadu rychlosti biologického stárnutí jedinců.
- zadáno vedoucím/školitelem