Hledáme signalizační dráhy regulující hojení poranění u embryí. Jako model používáme embrya drápatek, které jsou chopné zahojit velké poranění během několika hodin bez jizev. Pro nalezení vhodných kandidátů používáme sekvenování nové generace a kvantitativní PCR na jednobuněčné úrovni. Nalezené geny potom studujeme ve funkčních experimentech, kdy blokujeme nebo nadprodukujeme expresi daného genu. Fenotypové změny sledujeme pomocí imunohistochemie, in situ hybridizace a dalších metod. Student si během své práce osvojí širokou škálu přístupů a metodik, proto je důležitá zejména motivovace a schopnost rychle se učit novým věcem.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
We are looking for signaling pathway, which regulate wound healing. Xenopus embryos are used as a model, because they heal wounds quickly, efficiently and without scar. We are using next-generation sequencing and single cell qPCR to identify candidate genes and pathways. Candidate genes are further studied in functinal experiments, when we block or overexpress selected gene. Phenotype changes are determined using immunohistochemistry, in situ hybridization and other techniques. Student will use variety of approaches and methods, so his/her motivation and skill to quickly learn new things are important.
- zadáno vedoucím/školitelem