Odezvy na biotické stresy a na nedostatek živin mají řadu společných mechanismů, ale vykazují i specifické reakce. Obecnou odpovědí na nepříznivé podmínky životního prostředí je omezení růstu, které se může týkat celé rostliny nebo být zacíleno pouze na nadzemní část (deficit fosfátu). Disertační práce bude zaměřena na porovnání hormonálních změn vyvolaných odlišnými stresy (infekcí půdním patogenem a nedostatkem fosfátu), jak na úrovni jednotlivých hormonů a jejich metabolitů (pomocí LC/MS), tak na úrovni transkriptomu (stanovení hladin exprese vybraných genů pomocí qRT PCR). Sledované geny budou zahrnovat geny související s metabolismem nebo signální drahou hormonů, vybrané markery stresů (specifické transkripční faktory, transportéry fosfátu). Hormonální změny budou korelovány s fyziologickým stavem rostliny (pomocí stanovení integrity membrán, fotosyntetické aktivity). Práce se zaměří za separátní zhodnocení rostlinných odpovědí v jednotlivých orgánech. Dosažené výsledky přispějí ke stanovení vhodné strategie zvýšení tolerance vůči stresům.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
Responses to biotic stresses as well as nutrient deficiency share some common mechanisms as well as exhibit specific features. The general response to the adverse environment is suppression of the growth, which can be general or targeted especially to the above ground tissues (as in case of phosphate starvation). This PhD. the study will be focused on the comparison of hormonal responses to the contrasting stresses, soil pathogen infection and phosphate deficiency, both at the level of the metabolome (using LC/MS) and transcriptome (quantification of the expression of selected genes by q RT PCR). The followed genes will include hormone-related genes, selected stress markers (specific transcription factors, phosphate transporters). The hormonal changes will be correlated with the physiological state of plants (ion leakage, photosynthetic activity and DNA damage). The focus will be given to the separate evaluation of results from individual plant tissues. The obtained results will contribute to the elucidation of a suitable strategy to enhance plant tolerance.
