Antigenome defines a selection of mutated tumor peptides driving tumor-specific T-cell response
| Název práce v češtině: | Antigenom definuje výběr mutovaných peptidů pro nádorově-specifickou T-buněčnou imunitní odpověď |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Antigenome defines a selection of mutated tumor peptides driving tumor-specific T-cell response |
| Klíčová slova: | antigenom, T-buněčná odpověď, somatická mutace, MHC-restrikce, nádorový biomarker, imunoterapie nádorů, stratifikace pacientů, personalizovaná medicína |
| Klíčová slova anglicky: | antigenome, T-cell response, somatic mutation, MHC-restriction, tumor biomarker, tumor immunotherapy, patient stratification, personalized medicine |
| Akademický rok vypsání: | 2014/2015 |
| Typ práce: | bakalářská práce |
| Jazyk práce: | angličtina |
| Ústav: | Katedra buněčné biologie (31-151) |
| Vedoucí / školitel: | RNDr. Karel Drbal, Ph.D. |
| Řešitel: | Mgr. Petra Hadlová - zadáno vedoucím/školitelem |
| Datum přihlášení: | 13.11.2015 |
| Datum zadání: | 13.11.2015 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 18.08.2016 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 08.09.2016 |
| Oponenti: | RNDr. Michal Dibus, Ph.D. |
| Předběžná náplň práce |
| Cílem této bakalářské práce je popis nádorového antigenomu, který je definován jako ta část genomové sekvence, která po překladu a přepisu do proteinových lineárních motivů a složitějších struktur slouží jako cíle imunitní odpovědi. Naprostá většina dosud publikovaných prací takového systémového přístupu cílí protilátkovou odpověď v séru pacientů se specifickými chorobami, nejčastěji infekčními. Úkolem je: 1/ zmapování konkrétních výsledků serologického metodického přístupu a 2/následně se zaměřit na jeho aplikaci pro T-buněčnou odpověď, konkrétně pro využití v diagnostice nádorových (případně i infekčních) onemocnění. Dynamika cílových sekvencí/struktur v čase a selekce jejich podmnožiny, která je rozpoznaná imunitním systémem je klíčem k úspěšné identifikaci stratifikaci pacientů. Diskutovány budou dnešní detekční možnosti T-buněčné odpovědi v klinice. Klíčové zdroje: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23258224 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25409260 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24790791 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25164877 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24829748 Příklad infekčního onemocnění (TB): http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25009541 Metody: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24441473 |