Diverzita prasinofytních řas příbuzných plastidu euglen

• Název práce v češtině: Diverzita prasinofytních řas příbuzných plastidu euglen
• Název v anglickém jazyce: Diversity of prasinophyte algae related to the euglenid plastid
• Klíčová slova: Prasinofyta, euglenida, plastid, environmentální sekvenování, fylogeneze
• Klíčová slova anglicky: Prasinophytes, euglenids, plastid, environmental sequencing, phylogeny
• Akademický rok vypsání: 2014/2015
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra parazitologie (31-161)
• Vedoucí / školitel: doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 10.11.2014
• Datum zadání: 10.11.2014
• Datum odevzdání elektronické podoby: 01.05.2016
• Datum proběhlé obhajoby: 30.05.2016
• Oponenti: Mgr. Aleš Horák, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Cílem práce je analyzovat volně dostupná a během práce získaná molekulární data prasinofytních řas za účelem sestrojení fylogenetického stromu bohatého na prasinofytní zástupce, který by pomohl odhadnout, jaká z prasinofytních skupin je nejblíže příbuzná plastidu euglenidů. Zaměřovat se budeme především na geny kódované v plastidovém genomu (16S rRNA, RubisCO a další). Data bude řešitelka získávat z věřejně dostupných databází a z envinmentálních vzorků pomocí specifických primerů.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

The aim of the thesis is to analyze molecular data of prasinophyte algae either freely available or generated during the work. These data will be used to construct a phylogenetic tree rich with prasinophyte taxa, which could help to estimate which lineage is the most related to the plastid of euglenids. We will focus primarily on genes encoded in the plastid genome ( 16S rRNA RubisCO and others). The data will be obtained from public databases and envinmentálních samples using specific primers.