V rámci projektu bude zaveden nový systém pro značení proteinů za účelem vizualizace a charakterizace proteomu mitochondriálních organel dvou anaerobních parazatických prvoků Giardia intestinalis a Trichomonas vaginalis. Dojde k vytvoření konstruktů pro expresi APEX tagu v mitosomech a hydrogenosomech. Následovat bude analýza aktivity APEX proteinu a jeho využití při izolaci proteinů.