Vyšetření a klinický význam prediktivních markerů u pacientů s nemalobuněčným karcinomem plic (NSCLC)

• Název práce v češtině: Vyšetření a klinický význam prediktivních markerů u pacientů s nemalobuněčným karcinomem plic (NSCLC)
• Název v anglickém jazyce: Examination and clinical relevance of predictive markers in patiens with non small cell lung carcinoma (NSLC)
• Akademický rok vypsání: 2014/2015
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra biochemických věd (16-16160)
• Vedoucí / školitel: prof. PharmDr. Tomáš Šimůnek, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 01.11.2014
• Datum zadání: 14.07.2015
• Datum a čas obhajoby: 20.09.2016 09:00
• Datum odevzdání elektronické podoby: 02.08.2016
• Datum proběhlé obhajoby: 20.09.2016
• Oponenti: RNDr. Miloslav Macháček, Ph.D.
• Konzultanti: RNDr. Ivana Stružinská, Ph.D.

Zásady pro vypracování

V rámci zpracování bakalářské práce budou studovány vybrané prediktivní markery u pacientů s nemalobuněčným karcinomem plic (např. EGFR, ALK) ve vzorcích získaných při chirurgických výkonech. Vzorky vzaté do studie pocházejí především z Všeobecné fakultní nemocnice v Praze (VFN), které byly v časovém období dvou let 2014-2015 vyšetřeny v Laboratoři molekulární patologie na Ústavu Patologie 1.LF UK a VFN.
Práce bude vykonána na pracovišti studentky pod vedením konzultantky RNDr. Ivany Tiché, PhD.
Náplní bude zejména:
Zhodnocení kvality vstupního genetického materiálu pro molekulární analýzy z různých vstupních materiálů (formalinem fixované a do parafinu zalité tkáně, cytobloky, nátěry)
Analýza somatických mutací genu EGFR ve vzorcích nemalobuněčného karcinomu plic cílenou mutační analýzou pomocí komerčních kitů používaných v rutinní diagnostice.
Analýza přestaveb genu ALK pomocí fluorescenční in situ hybridizace (FISH).
Vyhodnocení spektra a frekvence mutantní populace
Literární rešerše týkající se genetických markerů a možností cílené léčby NSCLC pacientů.

Téma a charakter práce odpovídá zaměření pracoviště a bude vycházet z dat získaných při rutinní analýze. Pracoviště má k dispozici přístrojové i materiálové vybavení potřebné k práci. Hlavními používanými technikami bude izolace DNA z různých materiálů, horizontální gelová elektroforéza, metody mutační analýzy založené na polymerázové řetězové reakci a FISH.