Impact of the glycine-rich loop on the function of processing peptidases of the mitochondrial type
| Název práce v češtině: | Vliv glycinové smyčky na funkci "processing" peptidas mitochondriálního typu |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Impact of the glycine-rich loop on the function of processing peptidases of the mitochondrial type |
| Klíčová slova: | mitochondrie, signalni peptidasa, proteinovy transport, signalni sekvence |
| Klíčová slova anglicky: | mitochondrion, signal peptidase, protein transport, signal sequence |
| Akademický rok vypsání: | 2013/2014 |
| Typ práce: | rigorózní práce |
| Jazyk práce: | angličtina |
| Ústav: | Katedra biochemie (31-250) |
| Vedoucí / školitel: | |
| Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
| Datum přihlášení: | 06.08.2014 |
| Datum zadání: | 06.08.2014 |
| Datum potvrzení stud. oddělením: | 08.09.2014 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 06.08.2014 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 08.10.2014 |
| Předběžná náplň práce |
| Disertační práce bude vypracovávána v Laboratoři sekundárního metabolismu MBÚ AV ČR pod vedením Ing. Jiří Janaty, CSc. a náplní bude charakterizace dvou signálních peptidas mitochondriálního typu:
mitochondriální „processing“ peptidasy (MPP) ahydrogenosomální „processing“ peptidasy (HPP). V případě MPP půjde o detailní popis prvotního kontaktu, následného mechanismu rozpoznávání a translokace do aktivního centra enzymu. V případě HPP pak půjde o porovnávání celého mechanismu funkce s mechanismem funkce MPP s cílem objasnit důvody pro případné rozdíly ve funkci těchto dvou peptidas. Získané poznatky budou využity při odhalování evolučních souvislostí mezi hydrogenosomy a mitochondriemi, respektive při odhalování historie evoluce eukaryotické buňky, a v budoucnosti pak při navrhování specifických léčiv na bázi inhibitorů HPP. Za těmito účely budou využívány následující metody: - molekulární dynamika - cílená mutagenese proteinů - heterologní exprese proteinů - různé metody purifikace proteinů |