Substrate cleavage by mammalian Dicer isoforms

• Název práce v češtině: Štěpení substrátů isoformami savčího Diceru
• Název v anglickém jazyce: Substrate cleavage by mammalian Dicer isoforms
• Klíčová slova: Dicer, RNA interference, mikroRNA, helikáza, dvouvláknová RNA, purifikace proteinů, enzymová analýza
• Klíčová slova anglicky: Dicer, RNAi, miRNA, helicase, dsRNA, protein purification, cleavage assay
• Akademický rok vypsání: 2013/2014
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Vedoucí / školitel: prof. Mgr. Petr Svoboda, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 31.10.2013
• Datum zadání: 21.01.2014
• Datum odevzdání elektronické podoby: 02.05.2016
• Datum proběhlé obhajoby: 07.06.2016
• Oponenti: RNDr. Martin Pospíšek, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Štěpení substrátů isoformami savčího Diceru
RNA interference a mikroRNA dráha využívají malé RNA jako sekvenčně specifické průvodce pro post-transkripční kontrolu genové exprese. Obě dráhy využívají produkt ze stejného genu na produkci malých RNA z různých prekurzorů. U RNA interference, Dicer štěpí dlouhé dvouvláknové RNA na malé interferující RNA, zatímco mikroRNA jsou produkovány z genomicky kódovaných vlásenkových prekurzorů. Tento diplomový projekt se zaměřuje na roli savčích isoforem Diceru při in vitro zpracovávání různých prekurzorů malých RNA za účelem pochopení pravidel, kterými se řídí koexistence RNA interference a mikroRNA dráhy v savčích buňkách.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Substrate cleavage by mammalian Dicer isoforms
RNA interference and microRNA pathways employ small RNAs as sequence-specific guides for post-transcriptional control of gene expression. Both pathways utilize the same Dicer gene to generate small RNAs from different types of precursors. In the RNAi pathway, Dicer cleaves long double-stranded RNAs into short interfering RNAs while microRNAs are produced from genome-encoded small hairpin precursors. This thesis project will focus on distinct roles of mammalian Dicer protein isoforms in processing structurally different precursors of small RNAs in vitro in order to understand the rules governing co-existence of RNAi and microRNA pathways in mammalian cells.