Rekonstrukce morfologické evoluce a fylogenetických vztahů šupinatých chrysomonád rodu Mallomonas
Název práce v češtině: | Rekonstrukce morfologické evoluce a fylogenetických vztahů šupinatých chrysomonád rodu Mallomonas |
---|---|
Název v anglickém jazyce: | Reconstructing the evolution and fylogenetic relationships of silica-scaled chrysophyte genus Mallomonas |
Klíčová slova: | fylogeneze, morfologie, evoluce, zlativky |
Klíčová slova anglicky: | phylogeny, morphology, evolution, chrysophytes |
Akademický rok vypsání: | 2013/2014 |
Typ práce: | diplomová práce |
Jazyk práce: | čeština |
Ústav: | Katedra botaniky (31-120) |
Vedoucí / školitel: | doc. Mgr. Pavel Škaloud, Ph.D. |
Řešitel: | skrytý![]() |
Datum přihlášení: | 08.10.2013 |
Datum zadání: | 22.12.2013 |
Datum odevzdání elektronické podoby: | 14.08.2015 |
Datum proběhlé obhajoby: | 15.09.2015 |
Oponenti: | Mgr. Eliška Záveská, Ph.D. |
Předběžná náplň práce |
Základní data · Rod Mallomonas představuje běžně se vyskytující a druhově velmi bohatý rod zlativek (v současnosti je popsáno okolo 180 druhů) · Taxonomie rodu je založena na morfologii křemičitých šupin, pozorovaných v elektronovém mikroskopu · Molekulární data jsou známa pouze u 28 z přibližně 190 popsaných druhů. Ty navíc v naprosté většině pocházejí z kmenů izolovaných v JV Asii Cíle práce · Zpřesnit naše představy o evoluci rodu Mallomonas získáním molekulárních dat z dosud nenasekvenovaných druhů · Porovnat genetickou uniformitu Evropských a Asijských izolátů stejných, morfologicky definovaných druhů (tj., test robustnosti druhového konceptu) · Časově nakalibrovat evoluční historii rodu analýzou publikovaných fosilních dat · Studovat evoluci tvaru šupin, časově nakalibrovat hlavní morfologické transformace v evoluční historii rodu · Posoudit míru kryptické diverzity posouzením genetické variability druhu M. caudata Metodika · Sběr vzorků a izolace kmenů z lokalit ve střední Evropě (preferenčně ČR) · Izolace DNA, sekvenování SSU rDNA, rbcL a LSU rDNA u nově izolovaných druhů · Single-cell PCR markeru ITS rDNA u environmentálních kmeů druhu M. caudata · Multigenové fylogenetické analýzy (MrBayes, Garli, PAUP, BEAST) · Mapování evoluce tvaru (R, BayesTraits, Mesquite, TreeGradients) |