Analýza genového shluku kódujícího biosyntézu manumycinového antibiotika U-62162 a způsoby jeho modifikace

• Název práce v češtině: Analýza genového shluku kódujícího biosyntézu manumycinového antibiotika U-62162 a způsoby jeho modifikace
• Název v anglickém jazyce: Analysis of the biosynthetic gene cluster encoding biosynthesis of the manumycin antibiotic U-62162, and the ways of its modification.
• Klíčová slova: streptomycety, Streptomyces verdensis, manumycinová antibiotika, U-62162, biosyntéza, polyketidy, enoylreduktáza, C5N jednotka
• Klíčová slova anglicky: streptomyces, Streptomyces verdensis, manumycin antibiotics, U-62162, biosynthesis, polyketides, enoylreductase, C5N unit
• Akademický rok vypsání: 2012/2013
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: Ing. Miroslav Petříček, CSc.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 29.11.2012
• Datum zadání: 29.11.2012
• Datum odevzdání elektronické podoby: 13.08.2014
• Datum proběhlé obhajoby: 15.09.2014
• Oponenti: RNDr. Michaela Schierová, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Práce se bude zabývat analýzou genového shluku kódujícího biosyntézu polyketidového antibiotika U-62162 a jeho expresí v heterologním hostiteli. Při analýze funkcí jednotlivých genů bude kladen důraz na objasnění způsobu syntézy obou polyketidových řetězců, na faktory ovlivňující jejich délku, větvení a nasycení vazeb v řetězcích. S použitím metod genového inženýrství budou vytvořeny rekombinantní kmeny produkující molekuly antibiotika s modifikovanou strukturou. Analýza těchto látek proběhne s využitím metod TLC, sloupcové chromatografie, flash-chromatografie, HPLC a LC-MS. Získané metabolity budou užitečným výchozím materiálem pro další testování jejich biologických aktivit, zejména protizánětlivých, antibiotických či kancerostatických.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

The work will be aimed at analysis of the gene cluster coding for the biosynthesis of the polyketide antibiotic U-62162 and its expression in a heterologous host. The analysis of particular genes will be focused on explanation of the synthesis of both polyketide chains, on factors which control their lengths, their branching and saturation of carbon bonds. With the help of genetic engineering methods, there will be developed recombinant strains producing molecules of the antibiotic with modified structures. Analysis of those compounds will be performed using methods of TLC, column chromatography, flash-chromatography, HPLC, and LC-MS. The obtained metabolites will be a useful material for the further testing of their biological features, particularly antiinflammatory, antibiotic, or anticancer activities.