Ekologie hub, asociovaných s tlejícím dřevem v ekosystémech přirozených lesů

• Název práce v češtině: Ekologie hub, asociovaných s tlejícím dřevem v ekosystémech přirozených lesů
• Název v anglickém jazyce: Ecology of deadwood-associated fungi in the ecosystems of nature-like forests
• Klíčová slova: tlející dřevo, dekompozice, dřevorozkladné houby, sukcese, ITS – vnitřní přepisovaný mezerník, 454 pyrosekvenace, Ilumina MiSeq sekvenování
• Klíčová slova anglicky: dead wood, decomposition, wood-decaying fungi, succession, ITS – internal transcribed spacer, next-generation-sequencing
• Akademický rok vypsání: 2012/2013
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: prof. RNDr. Petr Baldrian, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 19.11.2012
• Datum zadání: 19.11.2012
• Datum odevzdání elektronické podoby: 02.05.2014
• Datum proběhlé obhajoby: 09.06.2014
• Oponenti: doc. RNDr. Ivo Konopásek, CSc.

Předběžná náplň práce

Mrtvé dřevo představuje specifický substrát, bohatý na organické živiny, jejichž dostupnost je však omezena nízkým obsahem dusíku a fyzikálními vlastnostmi dřeva. V mrtvém dřevě se proto vyvíjí specifické společenstvo mikroorganismů s převahou hub, které se mění v průběhu jeho rozkladu. Zatímco v hospodářských lesích je mrtvé dřevo odstraňováno, v přirozených lesích představuje důležitou zásobárnu živin, kvantitativně srovnatelnou se zásobou v půdě či živé rostlinné biomase. Cílem práce je pomocí molekulárních i mikrobiologických metod popsat složení společenstva na dřevě různých stromů a jeho změnu v průběhu rozkladu a porovnat ho se společenstvem v rostlinném opadu. U vzorků dřeva v jednotlivých fázích rozkladu bude popsána změna chemického složení, rychlost rozkladu a zastoupení extracelulárních enzymů pro dekompozici dřeva a tyto hodnoty budou použity pro vysvětlení rozdílů ve složení společenstev hub. Pro studium bude využito nejnovějších přístupů současné ekologie včetně next-generation-sequencing.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Deadwood represents a specific substrate, rich in organic nutrients. The availability of nutrients is, however, limited by low N content and the physical properties of wood. Because of that, highly specialised community of microorganisms develops in this substrate with a major contribution of fungi. The community develops along with the changes of wood quality during decomposition. While deadwood is removed in most forests, in the nature-like forests it represents a large nutrient pool, quantitatively comparable to that in the soil or in the standing plant biomass. The aim of this work is to characterise the fungal community associated with deadwood of various trees and in different stages of decomposition and to compare it with the litter-associated community. A combination of molecular methods (including next-generation-sequencing) and characterisation of community functioning and environmental factors that affect it will be used to achive these goals.