Práce se bude zabývat studiem biosyntézy polyketidových řetězců u producentů manumycinových antibiotik. Budou analyzovánu kroky biosyntetických drah určující délku a větvení polyenových řetězců antibiotik manumycinu A, asukamycinu a colabomycinu E. S použítím molekulárně-biologických metod budou vytvořeny mutantní kmeny producentů u nichž bude následně komplementována biosyntéza těchto částí molekul vložením homologních či heterologních genů kódujících tvorbu polyketidových řetězců. Produkty těchto rekombinantních kmenů budou analyzovány s použitím analytických metod zahrnujících sloupcovou chromatografii, TLC, flash-chromatografii, HPLC, MS a NMR. Výsledkem práce bude detailnější popis biosyntézy těchto látek potenciálně zajímavých pro klinickou praxi.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
The work will be aimed at the biosynthesis of polyketide chains of manumycin antibiotics. There will be analysed individual steps of biosynthetic routes determining the length and the branching of polyene chains of the antibiotics manumycin A, asukamycin and colabomycin E. With the help of molecular-biology methods, mutants will be prepared from the producers and the biosynthesis of those steps of biosynthetic paths will be complemented by homologous or heterologous genes ecoding polyketide chain formation. Metabolites of such recombinat strains will be analysed using analytical methods involving column chromatography, TLC, flash-chromatography, HPLC, MS, and NMR. The study will result in a more detailed characterisation of the biosynthesis of those, for clinical practice putatively interesting, compounds.
- zadáno vedoucím/školitelem