Biosyntéza spodních polyketidových řetězců manumycinových antibiotik - faktory ovlivňující jejich délku

• Název práce v češtině: Biosyntéza spodních polyketidových řetězců manumycinových antibiotik - faktory ovlivňující jejich délku
• Název v anglickém jazyce: Biosynthesis of lower polyketide chains in manumycin antibiotics - the length-affecting factors
• Klíčová slova: asukamycin, manumycin, polyketidy, biosyntéza, sekundární metabolity, streptomycety, délka polyketidových řetězců
• Klíčová slova anglicky: asukamycin, manumycin, polyketides, biosynthesis, secondary metabolites, streptomyces, polyketide chain length
• Akademický rok vypsání: 2011/2012
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: Ing. Miroslav Petříček, CSc.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 09.01.2012
• Datum zadání: 09.01.2012
• Datum odevzdání elektronické podoby: 05.05.2013
• Datum proběhlé obhajoby: 12.06.2013
• Oponenti: RNDr. Gabriela Mikušová, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Práce se bude zabývat studiem biosyntézy polyketidových řetězců u producentů manumycinových antibiotik. Budou analyzovánu kroky biosyntetických drah určující délku a větvení polyenových řetězců antibiotik manumycinu A, asukamycinu a colabomycinu E. S použítím molekulárně-biologických metod budou vytvořeny mutantní kmeny producentů u nichž bude následně komplementována biosyntéza těchto částí molekul vložením homologních či heterologních genů kódujících tvorbu polyketidových řetězců. Produkty těchto rekombinantních kmenů budou analyzovány s použitím analytických metod zahrnujících sloupcovou chromatografii, TLC, flash-chromatografii, HPLC, MS a NMR. Výsledkem práce bude detailnější popis biosyntézy těchto látek potenciálně zajímavých pro klinickou praxi.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

The work will be aimed at the biosynthesis of polyketide chains of manumycin antibiotics. There will be analysed individual steps of biosynthetic routes determining the length and the branching of polyene chains of the antibiotics manumycin A, asukamycin and colabomycin E. With the help of molecular-biology methods, mutants will be prepared from the producers and the biosynthesis of those steps of biosynthetic paths will be complemented by homologous or heterologous genes ecoding polyketide chain formation. Metabolites of such recombinat strains will be analysed using analytical methods involving column chromatography, TLC, flash-chromatography, HPLC, MS, and NMR. The study will result in a more detailed characterisation of the biosynthesis of those, for clinical practice putatively interesting, compounds.