Témata prací (Výběr práce)Témata prací (Výběr práce)(verze: 384)
Detail práce
   Přihlásit přes CAS
Charakterizace fenotypu a genotypu kmenů Staphylococcus aureus a Pseudomonas aeruginosa od pacientů s cystickou fibrózou
Název práce v češtině: Charakterizace fenotypu a genotypu kmenů Staphylococcus aureus a Pseudomonas
aeruginosa od pacientů s cystickou fibrózou
Název v anglickém jazyce: Fenotype and genotype chrakterization of Staphylococcus aureus and Pseudomonas
aeruginosa strains isolated from cystic fibrosis patients
Klíčová slova: Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, fenotyp, genotyp, cystická fibróza, sputum
Klíčová slova anglicky: Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, fenotyp, genotyp, cystic fibrosis, sputum
Akademický rok vypsání: 2010/2011
Typ práce: bakalářská práce
Jazyk práce: čeština
Ústav: Ústav lékařské chemie a klinické biochemie (13-352)
Vedoucí / školitel: doc. MVDr. Oto Melter, Ph.D.
Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
Datum přihlášení: 04.01.2011
Datum zadání: 04.01.2011
Datum a čas obhajoby: 31.05.2011 14:00
Datum odevzdání elektronické podoby:08.05.2011
Datum odevzdání tištěné podoby:08.05.2011
Datum proběhlé obhajoby: 31.05.2011
Oponenti: MUDr. Vanda Chrenková
 
 
 
Seznam odborné literatury
1. VÁVROVÁ, V. et al. Cystická fibróza v praxi, Vyd. 1. Praha: Professional publishing, 2003. ISBN 80-86419-32-0
2. VÁVROVÁ, V., et al. Cystická fibróza. Vyd. 1. Praha : Grada Publishing, 2007. 516 s. ISBN 80-247-0531-1.
3. HODSON, M. et al.: Cystic fibrosis, Vyd. 3. Stock: Hardback, 2007. ISBN ISBN13: 9780340907580
4. VOTAVA, M. a kol.: Lékařská mikrobiologie speciální. Brno: Neptun, 2003. 495 s. ISBN 80-902896-6-55.

5. Euzéby J.P.: List of procaryotic names wit standing in nomenclature, http://www.bacterio.cict.fr/s/staphylococcus.html, 6.4.2011

6. MURRAY, P. R. et al.. Medical mikrobiology, 5 edition. USA: Elsevier mosby, 2005. 963 s. ISBN 978-0-323-03303-9.

7. LINA, G., et al. Involvement of Panton-Valentine Leukocidin–producing Staphylococcus aureus in primary skin infections and pneumonia. Clinical infectious diseases. 1999, vol.29, 5, s. 1128-1132.

8. MAC FADDIN, J. F.: Biochemical tests for idetification of medical bakteria, 1. vydání. Baltimore: The Williams and Wilkins copany, 1976. 312 s. ISBN 0-683-95314-0

9. BEDNÁŘ, M. a kol.: Lékařská mikrobiologie: bakteriologie, virologie, parazitologie, Vyd. 1. Praha: Triton, 1996. 560 s. ISBN 80-2380-297-6.

10. PATEL, A. H., et al. Virulence of Protein A-Deficient and Alpha-Toxin-Deficient Mutants of Staphylococcus aureus Isolated by Allele Replacement. Infection and immunity. December 2008, vol. 55, 12, s. 3103-3110.

11. GORDON, R. J., et al. Pathogenesis of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Infection. Clinical infectious disease. 2008, vol. 46, 5, s. 350-359.

12. EARSS, 2008 (European Antimicrobial Resistance Surveillance System). www.hpsc.ie/.../EuropeanAntimicrobialResistanceSurveillanceSystemEARSS/EARSSSurveillanceReports/2008Reports/File,3186,en.pdf 16.3.2011

13. MELTER, Oto. Průkaz a molekulární charakterizace kmenů meticilin rezistentních Staphylococcus aureus a Bartonella nehselae v ČR. Praha, 2003. Dizertační práce. 3.LF UK.

14. SCHINDLER, J.: Mikrobiologie pro studenty zdravotnických oborů, Vyd. 1. Praha: Grada Publishing, 2010. 223 s. ISBN 978-80-247-3170-4.

15. LYCZAK, J. B., et al. Lung Infections Associated with Cystic Fibrosis : microbiologic aspects of cystic fibrosis lung infections. Clinical Microbiology Reviews. April 2002, vol.15, 2, s. 194-222.

16. VON EIFF, CH., et al. Staphylococcus aureus small colony variant: a chaleng to microbiologists and alinicians. Journal of antimicrobials agents. June 2008, vol.31, 6, s. 507-510.

17. BECKER, K., et al. Fourier-Transform Infrared Spectroscopic Analysis Is a Powerful Tool for Studying the Dynamic Changes in Staphylococcus aureus Small-Colony Variants. Journal of clinical microbiology. September 2006, vol.44, 9, s. 3274-3278.

18. SAIMAN, L., et al. Infection control in cystic fibrosis. Clinical microbiology reviews. January 2004 , vol.17, 1, s. 57-71.

19. DORING, G., et al. Early invention and prevention of lung disease in cystic fibrosis: a Europea consensus. Journal of cystic fibrosis. June 2004, vol.3, 2, s. 67-91.

20. MELTER, O., et al. Update on the major clonal types of methicillint-resistant Staphylococcus aureus in the Czech republic. Journal of clinical microbiology. November 2003, vol.41, 11, s. 4998-5005.
21. JAWETZ, et al.: Medical microbiology, 24. vydání. USA: The Mcgraw-Hill Companies, 2007. 818 s. ISBN 978-0-07-147666-9.

22. HOIBY, N., et al. Pseudomonas aeruginosa and the in vitro and in vivo biofilm mode growth. Microbes anf infections. 2001, vol.3, 1, s. 23-35.

23. JELSBAK, M., et al. Molecular epidemiology and dynamics of pseudomonas aeruginosa populations in lungs of cystic fibrosis patients. Infection and immunity. 2007, vol.75, 5, s. 2214-2224.

24. Mahenthiralingam, E. et al. Use of colony-based bacterial strain typing for tracking the fate of Lactobacillus strains during human consumption, BMC Microbiology. 2009, vol.9,251

25. PROCTOR, R. A., et al. Persistent and relapsing infections associated with small colony variant Staphylococcus aureus. Clinical infectious disease. 1995, vol.20, 1, s. 95-102.

26. National Food Institute, 2008 http://www.crl-ar.eu/208-eqas.htm 20.4.2011

27. KOČÁREK, E.: Molekulární biologie v medicíně, Vyd. 1. Brno : Národní centrum ošetřovatelství a nelékařských zdravotnických oborů, 2007. 218 s. ISBN 978-80-7013-450-4.

28. PRITCHARD, D. J. et al.: Základy lékařské genetiky,Vyd. 1. Praha: Galén, 2007. 182 s. ISBN 978-80-7262-449-2.

29. DOLEŽALOVÁ, V. a kol.: Laboratorní technika v klinické biochemii a toxikologii, Vyd. 1. Brno: Idvpz, 1995. 286 s. ISBN 80-7013-198-5.

30. http://old.lf3.cuni.cz/mikrobiologie/bak/uceb/obsah/disktest/disktest.htm30.3.


31. KAHL, B. C., et al. Thymidine-dependent Small colony variants of Staphylococcus aureus exhibit gross morphological and ultrastructural changes consistent with impaired cell separation. Journal of clinical microbiology. January 2003, vol.41, 1, s. 410-413.

32. BESIER, S., et al. The thymidine-dependent small-colony-variant phenotype is associated with hypermutability and antibiotic resistance in clinical staphylococcus aureus isolates. Antimicrobial agents and chemotherapy. June 2008, vol.52, 6, s. 2183-2189.

33. MELTER, O., et al. Small Colony Variants of Staphylococcus aureus – review. Folia Microbiologica. December 2010, vol. 55, 6, s. 548-558.

34. BALOWS, A., et al. Topley & Wilsons Microbiolgy and microbial infections. Vyd. 9. Great Britain : Arnold, 1999. 1501 s. ISBN 0340663170.

35. LEWIS, K. Riddle of biofilm resistance. Antimicrobial agents and chemotherapy. April 2001, vol.45, 4, s. 999-1007.
Předběžná náplň práce
Cystická fibróza (mukoviscidóza) patří mezi nejčastější autozomálně recesivní dědičné onemocnění. V dnešní době, díky včasné diagnostice a komplexní terapii, lze výrazně zlepšit kvalitu života pacientů s tímto nevyléčitelným onemocněním. Nejčastěji se onemocnění projevuje opakovanými infekcemi dýchacích cest. V průběhu dlouhodobé léčby antibiotiky bakteriální původci mohou výrazně měnit své vlastnosti, což vede k problémům při jejich diagnostice a testování citlivosti k antibiotikům. V dětském věku jsou tyto infekce způsobeny nejčastěji Staphylococcus aureus, v průběhu dospívání pacienti nejčastěji trpí infekcemi způsobenými Pseudomonas aeruginosa.
Cílem práce byla charakterizace vybraných kmenů Staphylococcus aureus (n=5) a Pseudomonas aeruginosa (n=10) izolovaných od pacientů s cystickou fibrózou a detailní analýza jejich neobvyklých vlastností. Tyto kmeny jsme studovaly polyfázovým přístupem s použitím fenotypových (přímý průkaz v klinickém materiálu pomocí mikroskopie, biochemické identifikace pomocí zkumavkových metod a diagnostických souprav, průkaz citlivosti k antibiotikům) a genotypových metod (identifikace pomocí amplifikace DNA druhově specifických genů, klonální analýza DNA pomocí fingerprintových metod).
Fenotypová a genotypová analýza kmenů S. aureus a P. aeruginosa potvrdila jejich výjimečné biologické vlastnosti, které je nutné při identifikaci a stanovení citlivosti k antibiotikům zohlednit pro jejich úspěšnou diagnostiku a léčbu.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
Cystic fibrosis (mucoviscidosis) is the most common autosomal recessive hereditary disease. Nowadays, thanks to early diagnosis and comprehensive treatment can significantly improve the quality of life of patients with this incurable disease. Most often the disease is manifested by repeated respiratory infections. During long-term antibiotic treatment bacterial agents can significantly change their features, which lead to problems in their diagnosis and antibiotic susceptibility testing. In childhood infections are usually caused by Staphylococcus aureus. During adolescence patients often suffer from infections caused by Pseudomonas aeruginosa.
The aim of the bachelor thesis was the characterization of selected strains of Staphylococcus aureus (n = 5) and Pseudomonas aeruginosa (n = 10) isolated from patients with cystic fibrosis and a detailed analysis of their unusual features. These strains were studied using the polyphase approach with phenotypic (direct detection in clinical material by using microscopy, biochemical identification using test-tube methods and diagnostic kits and evidence of sensitivity to antibiotics) and genotypic methods (identification by DNA amplification of species-specific genes, clonal analysis using methods fingerprint DNA analysis).
Phenotypic and genotypic analysis of strains of S. aureus and P. aeruginosa confirmed its unique biological features that are necessary for identification and antibiotic susceptibility testing for successful diagnosis and treatment of the infections.
 
Univerzita Karlova | Informační systém UK