Zvýšení diagnostické efektivity QF-PCR pro vyšetření aneuploidií z plodové vody

• Název práce v češtině: Zvýšení diagnostické efektivity QF-PCR pro vyšetření aneuploidií z plodové vody
• Název v anglickém jazyce: The increased diagnostic efficiency of QF-PCR for aneuploidy of amniotic fluid
• Klíčová slova: QF-PCR,STR markery, prenatální diagnostika, trizomie
• Klíčová slova anglicky: QF-PCR,STR markers, prenatal diagnostics, trizomie
• Akademický rok vypsání: 2010/2011
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra antropologie a genetiky člověka (31-110)
• Vedoucí / školitel: doc. MUDr. Milan Macek, CSc.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 20.12.2010
• Datum zadání: 20.12.2010
• Datum odevzdání elektronické podoby: 15.08.2013
• Datum proběhlé obhajoby: 10.09.2013
• Oponenti: RNDr. Roman Šolc, Ph.D.

Seznam odborné literatury

INTRODUCTION AND OBJECTIVE: Thanks to its reliability, speed, and cost efficiency, QFPCR MLPA are gradually replacing the examination of long-term amniotic fluid cell cultures. However, it is necessary to increase the diagnostic efficiency of selecting additional STR markers in QFPCR to ensure selection of the most informative new markers and provide for all testing parental and meiotic origin of aneuploidy. The range of markers will therefore be extended for chromosomes 16, 18 and 22, which have not been used here and also to determine the population frequency of heterozygous genotypes in our population, to ensure application of STR markers for optimal prenatal diagnosis, . Using MLPA in amniotic fluid cells is not possible in at least 10% of diagnosis, due to the lack of DNA or the DNA has degraded by its demise. In this respect the latest testing methods for whole genome amplification of DNA will be used to to ensure a reliable diagnosis from the minimum number of remaining vital cells.
MATERIAL: Amniotic fluid - collected by amniocentesis in pregnant women with high genetic risk.
METHODS: Utilizing current methods of MLPA and QFPCR used by molecular genetic laboratory UBLG. The latest RUBIKON kits will used as part of the WGA evaluation. Work will be closely connected with problems VZFNM partial task VZFNM 6101, MZOFNM2005, under direct leadership of the Mgr. L. Dvorakova with participation in publishing activity, linked to up to date achievements. Material, technical support and financial support for this work are fully ensured.

Předběžná náplň práce

ÚVOD a CÍL:
QFPCR svou spolehlivostí, rychlostí a ekonomičností nahrazují postupně vyšetření z dlouhodobých kultur buněk plodové vody. Je však nutno zvýšit diagnostickou efektivitu výběrem dalších STR markerů u QFPCR tak, aby bylo možno výběrem nejinformativnějších nových markerů možno zajistit u všech vyšetření parentální a meiotický původ aneuploidie. Bude proto rozšířeno spektrum markerů pro chromosomy 15, 16 a 22, které u nás dosud nebyly použity a zjistit rovněž populační frekvenci jejich heterozygotních genotypů v naší populaci, aby byly do prenatální diagnostiky zavedeny nové STR markery diagnosticky nejvhodnější.
MATERIÁL:
Plodová voda - odebraná amniocentosou u geneticky rizikových gravidit.
METODY:
Využití současné metody QFPCR, používaných na molekulárně genetické laboratoři UBLG. Pro WGA ověření nejnovějších metod kitů RUBIKON, dosud u nás nepoužívaných.Práce bude úzce navazovat na řešení problémů VZFNM dílčího úkolu 6101 VZFNM, MZOFNM2005, pod přímým vedením Mgr L. Dvořákové se spoluúčastí na publikační aktivitě, vázané na dosažené výsledky. Materiální, technické zajištění i finanční podpora práce je proto plně zajištěna.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

INTRODUCTION AND AIM:
QFPCR its reliability, speed and economy gradually replaced examination of long-term cultures of amniotic fluid. However, it is necessary to increase the diagnostic efficiency of the selection of other STR markers in QFPCR so that it was possible to select nejinformativnějších new markers can be provided for all the tests and the parental origin of meiotic aneuploidy. It will therefore be expanded range of markers for chromosomes 15, 16 and 22 are with us still have not been used and also determine the population frequency of heterozygous genotypes in our population that do prenatal diagnosis introduced the new STR markers diagnostically appropriate.
MATERIAL:
Amniotic fluid - amniocentosou collected at genetic risk pregnancies.
METHODS:
The use of current methods QFPCR, used for molecular genetic laboratory UBLG. The WGA validation latest methods RUBIKON kits, still with us unused.The work will be closely linked to problem solving VZFNM subtask VZFNM 6101, MZOFNM2005, under the direct guidance of Mgr L. Dvořákové a deductible on publishing activity, linked to the results achieved. Material, technical and financial support to ensure work is therefore fully assured.