Studium interakcí biomolekul metodou resonance povrchových plasmonů
| Název práce v češtině: | Studium interakcí biomolekul metodou resonance povrchových plasmonů |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Study of biomolecular interactions by the method of surface plasmon resonance |
| Akademický rok vypsání: | 2006/2007 |
| Typ práce: | diplomová práce |
| Jazyk práce: | čeština |
| Ústav: | Fyzikální ústav UK (32-FUUK) |
| Vedoucí / školitel: | prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc. |
| Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
| Datum přihlášení: | 20.10.2006 |
| Datum zadání: | 20.10.2006 |
| Datum a čas obhajoby: | 26.05.2008 00:00 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 26.05.2008 |
| Datum odevzdání tištěné podoby: | 20.04.2008 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 26.05.2008 |
| Oponenti: | Ing. Ivan Rosenberg, CSc. |
| Konzultanti: | prof. Ing. Jiří Homola, CSc., DSc. |
| Zásady pro vypracování |
| 1. Seznámit se s principy a technickým řešením SPR biosenzorů.
2. Osvojit si technologie imobilizací receptorů na povrchu senzoru. 3. Prostudovat teorii kinetiky tvorby a rozpadu komplexů v hydrodynamických podmínkách průtočných mikrokomůrek senzorů. 4. Navrhnout a realizovat sérii experimentů zaměřených na tvorbu a rozpad komplexů klíčových biomolekul. 5. Provést komplexní vyhodnocení, stanovit kinetické konstanty interakcí a zhodnotit jejich přesnost. |
| Seznam odborné literatury |
| Surface Plasmon Resonance Based Sensors, J. Homola ed., Springer-Verlag, Berlín 2006, ISBN 3540339183
Hana Vaisocherová: Monitoring of biomolecular interactions for nucleic acids research. Dizertační práce, MFF UK, Praha 2006 Soubor vybraných vědeckých článků |
| Předběžná náplň práce |
| Předmětem této práce bude teoretické a experimentální studium biomolekulárních interakcí pomocí optických senzorů založených na rezonační excitaci povrchových plasmonů. Teoretická část práce bude věnována analýze biomomolekulárních interakcí v realistických hydrodynamických podmínkách mikrofluidních systémů.
V experimentální části práce budou s využitím teoretického aparátu a unikátního senzoru s povrchovými plasmony studovány vybrané biomolekulární interakce, například DNA-DNA a protein-protein. Práce bude řešena ve spolupráci s Oddělením optických senzorů ÚRE AV ČR, kde budou prováděny experimenty. |