Tato práce se bude zabývat charakterizací interakcí proteinů polyomavirů s proteiny signalizační dráhy cGAS-STING, zejména s proteinem STING. První část práce se budě věnovat charakterizaci interakce proteinu STING a MT antigenu, virového proteinu kódovaného myším polyomavirem. Dle předběžných výsledků se protein STING a MT nacházejí ve stejných kompartmentech proto budeme prokazovat: i) vzájemnou interakci těchto proteinů metodou imunoprecipitace a ii) funkční dopad této interakce/stejné lokalizace na signalizační dráhu cGAS-STING (aktivace proteinu STING v přítomnosti MT proteinu - fosforylace proteinu STING, relokalizace proteinu IRF-3 do jádra způsobená aktivací proteinu STING, hladina exprese interferonu beta). Druhá část práce bude navazovat na náš předchozí výzkum vyhledávání interakčních partnerů proteinu STING v buňkách infikovaných BK polyomavirem. Cílem bude ověřit interakce kandidátních proteinů s proteinem STING (vzájemná kolokalizace, imunoprecipitace) a popřípadě jejich roli v cGAS-STING signalizační dráze v buňkách infikovaných BK virem.
- zadáno a potvrzeno stud. odd.