Molekulárně-epidemiologická analýza kmenů Mycobacterium tuberculosis izolovaných na území Plzeňského kraje včetně detailní charakterizace kmenů rezistentních na antituberkulotika
| Název práce v češtině: | Molekulárně-epidemiologická analýza kmenů Mycobacterium tuberculosis izolovaných na území Plzeňského kraje včetně detailní charakterizace kmenů rezistentních na antituberkulotika |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Molecular-epidemiological analysis of Mycobacterium tuberculosis strains isolated in the West-Bohemian Region of the Czech Republic including detailed characterisation of anti-tuberculosis drugs-resistant strains |
| Klíčová slova: | tuberkulóza – Mycobacterium tuberculosis – genotypizace – WGS – rezistence |
| Klíčová slova anglicky: | tuberculosis - Mycobacterium tuberculosis - genotyping - WGS - resistance |
| Akademický rok vypsání: | 2011/2012 |
| Typ práce: | disertační práce |
| Jazyk práce: | čeština |
| Ústav: | Ústav mikrobiologie (14-510) |
| Vedoucí / školitel: | prof. Ing. Jaroslav Hrabák, Ph.D. |
| Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
| Datum přihlášení: | 31.01.2012 |
| Datum zadání: | 31.01.2012 |
| Datum potvrzení stud. oddělením: | 31.01.2012 |
| Datum a čas obhajoby: | 25.09.2019 14:00 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 28.06.2019 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 25.09.2019 |
| Oponenti: | doc. MUDr. Pavel Čermák, CSc. |
| prof. MUDr. Filip Růžička, Ph.D. | |
| Předběžná náplň práce |
| Práce je zaměřena na molekulárně-epidemiologickou analýzu rezistentních kmenů M. tuberculosis deponovaných ve sbírce Ústavu mikrobiologie, FN UK v Plzni.. Cílem práce je porovnání genotypizačních metod a výběr vhodné metody pro molekulárně-genetickou charakterizaci kmenů M. tuberculosis. Tato metoda, umožní sledování příbuznosti izolátů, včetně možného nalezení epidemiologických souvislostí.
V další fázi řešení problematiky je pozornost věnována nalezení dalších molekulárních markerů pro detekci rezistence k ostatním skupinám antituberkulotik. Tato analýza má potvrdit či vyvrátit hypotézu, zda rezistence k antituberkulotikům je dominantní pouze u určitých klonů, případně zda populace M. tuberculosis je heterogenní a souvislosti s určitými klony nelze nalézt. Práce je doplněna o analýzu nově zaváděných metod do laboratorní diagnostiky tuberkulózy, metody identifikační hmotnostní spektrometrií a metody průkazu latentní tuberkulózy. Z předkládaných výstupů je očekávána publikace alespoň dvou článků v mezinárodních časopisech s IF. |
| Předběžná náplň práce v anglickém jazyce |
| The dissertation thesis is focused on molecular-epidemiological analysis of resistant M. tuberculosis strains deposited in the collection of the Department of Microbiology, Faculty Hospital UK Pilsen. The aim of the work is to compare genotyping methods and to select a suitable method for molecular-genetic characterization of M. tuberculosis strains. This method will allow to monitor the affinity of isolates, including the possible finding of epidemiological connections.
In the next phase of the problem, attention is paid to finding other molecular markers for the detection of resistance to other groups of antituberculotics. This analysis should confirm or disprove the hypothesis that resistance to antituberculotics is dominant only in certain clones or if M. tuberculosis population is heterogeneous and the association with certain clones cannot be found. The work is supplemented by analysis of new methods implemented to laboratory diagnostics of tuberculosis, the method of identification by mass spectrometry and the method of detection of latent tuberculosis. At least two articles in international IF journals are expected to be published. |