• Grantová agentura UK

Výsledky projektu Vizualizace molekulárních struktur pomocí rekurzivního sledování paprsku v reálném čase

Výsledky

Typ výsledku Autor celku Název celku (Celkem 11 zázn.)
Marsalek, Lukas; Dehof, Anna Katharina; Nickels, Stefan; Lenhof, Hans-Peter; Slusallek, Philipp; Hildebrandt, Andreas, v roce 2009 i 2010 jsme se zúčastnili soutěží o obálku prestižního EMBO žurnálu. Zaslali jsme snímky vytvořené pomocí naší implementace rekurzivního sledování paprsku. V roce 2009 jsme se umístili na 39 místě ze 700, v roce 2010 na 32 z 1500. V příloze lze nalézt oba zaslané snímky. [Jiný výsledek]
Marsalek, Lukas; Geogiev, Iliyan; Dehof, Anna Katharina, Lenhof, Hans-Peter; Slusallek, Philipp; Hildebrandt, Andreas, Real-Time Ray Tracing of Complex Molecular Scenes, článek jsme zaslali k publikaci na 4th International Symposium Information Visualization in Biomedical Informatics 2010. Výsledky recenzí a informace o přijetí ještě nejsou známy. http://www.graphicslink.co.uk/IV10/ [Jiný výsledek]
Marsalek, Lukas; Nickels, Stefan; Lenhof, Hans-Peter; Slusallek, Philipp; Hildebrandt, Andreas, Real-Time Volume Ray Tracing For Bioinformatics Applications, poster na Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) and European Conference on Computational Biology (ECCB), Stockholm, Sweden, červen, 2009, http://www.iscb.org/ismbeccb2009/index.php [Jiný výsledek]
Marsalek, Lukas; Dehof, Anna Katharina; Georgiev, Iliyan; Stöckel, Daniel; Nickels, Stefan; Lenhof, Hans-Peter; Slusallek, Philipp; Hildebrandt, Andreas, Real-Time Ray Tracing and Volume Rendering In Molecular Visualization, poster na EMBO Workshop on Visualizing Biological Data, Heidelberg, Germany, březen 2010, http://vizbi.org. Tento poster byl jeden z pěti nominovaných na cenu "Best Poster Award" [Jiný výsledek]
Hildebrandt, Andreas; Dehof, Anna Katharina; Stoeckel, Daniel; Nickels, Stefan; Marsalek, Lukas; Lenhof, Hans-Peter; Kohlbacher, Oliver, BALLView: An object-oriented molecular visualization and modeling framework, verze 2.0-pre-alpha. Výsledky práce na projektu jsme zaintegrovali do open-source nástroje pro vizualizaci a modelování v bioinformatice tak, aby vyvinuté metody byly dostupné široké vědecké veřejnosti. Zatím experimentální verze pro operační systém Windows je dostupná na této adrese http://www.ballview.org/Downloads [Jiný výsledek]
Dehof, Anna Katharina; Georgiev, Iliyan; Marsalek, Lukas; Stöckel, Daniel; Nickels, Stefan; Lenhof, Hans-Peter; Slusallek, Philipp; Hildebrandt, Andreas, Real-time ray tracing of complex molecular scenes with BALLView and RTfact, poster na Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) and European Conference on Computational Biology (ECCB), Stockholm, Sweden, červen, 2009, http://www.iscb.org/ismbeccb2009/index.php [Jiný výsledek]
Dehof, Anna Katharina; Marsalek, Lukas; Georgiev, Iliyan; Stöckel, Daniel; Nickels, Stefan; Lenhof, Hans-Peter; Slusallek, Philipp; Hildebrandt, Andreas, Interactive Real-Time Ray Tracing In Molecular Visualization, poster na German Conference on Bioinformatics 2009, Halle, Germany, září 2009, http://www.gcb2009.de/. Tento poster vyhrál cenu "Best Poster Award" [Jiný výsledek]
Phillips, Mike; Georgiev, Iliyan; Dehof, Katharina Anna; Nickels, Stefan; Marsalek, Lukas; Lenhof, Hans-Peter; Hildebrandt, Andreas; Slusallek, Philipp, Measuring Properties of Molecular Surfaces Using Ray Casting, článek o měření objemů, povrchů a detekci "kaps" (cavities), který jsme publikovali na konferenci IEEE International Workshop on High Performance Computational Biology, Atlanta, USA, duben 2010, http://www.hicomb.org/proceedings.html [Jiný výsledek]
Maršálek, Lukáš, v časopise Pixel č. 153 (9/2009) jsme publikovali popularizační článek s názvem "Počítačová grafika ve vědě - Rekurzivní sledování paprsku a návrh nových léků", který shrnuje naši práci na tomto projektu. http://www.pixel.cz/2122-pocitacova-grafika-ve-vede [Jiný výsledek]
Maršálek Lukáš, Slusallek Philipp, Přednáška světového výrobce grafických čipů NVidia konaná jak na největší mezinárodní konferenci o počítačové grafice SIGGRAPH 2008 v Los Angeles, tak na mezinárodní exhibici počítačové grafiky NVision 08 v San Jose, kde byla naše metoda uvedena jako příklad využití moderních grafických čipů pro výpočty nad objemovými daty. Prezentace dostupná na: http://developer.nvidia.com/object/nvision08-IRT.html, snímky 27, 28 a 29 [Jiný výsledek]
Maršálek Lukáš, Hauber Armin, Slusallek Philipp, Poster Symposium on Interactive Ray Tracing 2008, Los Angeles. PDF: http://graphics.cs.uni-sb.de/~odin/irt08Poster.pdf [Jiný výsledek]