velikost textu
Výsledky projektu Role lidského Eukaryotického iniciačního faktoru 3 v iniciaci translace a v rozpoznávání start kodonu
Výsledky
  Typ výsledku
Autor celku
Název celku(Celkem 10 zázn.)
|
|---|
| Bochler, Anthony. Structural Differences in Translation Initiation between Pathogenic Trypanosomatids and Their Mammalian Hosts. Cell Reports, 2020, sv. 33, s. 108534–108534. ISSN 2211-1247. IF 8.1. [Článek v časopise] Publikace vznikla ze spolupráce s francouzkou labortoří doktora Yasera Hashema. Hlavní řešitelka sdílí prvoautorství s dalšími dvěma kolegy z této laboratoře. Tito kolegové získali a zpracovali data z CryoEM struktury 43S preinicačního komplexu Trypanosoma cruzi, my jsme přispěli vazebnými studiemi. Společně jsme zpracovali článek, který charakterizuje atributy, které jsou unikátní pro kinetoplastida a které jsou obecné pro eukaryota. Popisujeme rozdíly mezi organismem T.cruzi a jeho lidským hostitelem. V publikaci prezentujeme data mapující vazebná místa pro lidské iniciační faktory eIF1 a eIF5 na eIF3c (cíl C i.). Data jsou zde prezentované v kombinaci s analogickou studií pro organismus T.cruzi a se strukturními daty T.cruzi 43S-PIC. Tato struktura je mimo jiné unikátní v tom, že zachycuje molekulární detaily vazebného místa eIF1 na eIF3c. Pomocí srovnání sekvencí eIF3c různých eukaryotických organismů diskutujeme posun vazebných míst eIF1 a eIF5 u eukaryot. V publikaci prezentujeme i další vazebné studie lidských iniciačních faktorů a to včetně eIF3d a eIF3e. |
| Prilepskaja Terezie, Obrázek 3: Přehled počtu získaných buněčných linií HEK293T po aplikaci Crispr/Cas9 a ssODN donorů nesoucích mutaci pro eIF3c_R3N či eIF3c_F5A. Dílčí výsledek [Jiný výsledek] |
| Prilepskaja Terezie, Obrázek 2: Testování aktivity Crispr/Cas9 s použitím odlišných gRNA na cílových sekvencích a potencionálních off-targetech. Dílčí výsledek [Jiný výsledek] |
| Prilepskaja Terezie, Obrázek 4: Ověření správného vnesení mutací ve vybraných koloniích stabilních linií HEK293T- eIF3c_F5A a HEK293T- eIF3c_R3N Dílčí výsledek [Jiný výsledek] |
| Prilepskaja Terezie, Obrázek 1: Zpřesňování a ověření vazebného místa eIF5 na eIF3c. Dílčí výsledek [Jiný výsledek] |
| Prilepskaja Terezie, Obrázek 2: Protein-proteinová interakce eIF3c-NTD s GST-eIF5. [Jiný výsledek] |
| Prilepskaja, Terezie., Obrázek 1 (Sui assay GUG, AAG) [Jiný výsledek] |
| Prilepskaja, Terezie, Poster prezentovaný na online konferenci CSHL 2020 (Cold Spring Harbor Laboratory) [Jiný výsledek] |
| Bochler et al., (Prilepskaja Terezie, Leoš Valášek) , Připravovaný manuskript [Jiný výsledek] |
| Prilepskaja Terezie, Poster prezentovaný na EMBO konferenci „Protein Synthesis and Translation Control“ [Jiný výsledek] |