Základy biochemie - MB150P40

• Anglický název: Biochemistry - The Principles
• Zajišťuje: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2008 do 2012
• Semestr: letní
• E-Kredity: 5
• Způsob provedení zkoušky: letní s.:
• Rozsah, examinace: letní s.:3/0, Zk [HT]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Garant: doc. RNDr. Petr Folk, CSc.
• Vyučující: prof. RNDr. Jan Brábek, Ph.D.; doc. RNDr. Petr Folk, CSc.; doc. RNDr. Martin Kalous, CSc.
• Atributy: Modul Buněčná a molekulární biologie
• Neslučitelnost : MB150P04
• Záměnnost : MB150P04
• Je prerekvizitou pro: MB140P33I
• Je záměnnost pro: MB150P04

Anotace

čeština

Poslední úprava: PUTA (31.05.2005)

Přednáška je zkrácenou verzí přednášky Biochemie (B150P04) a je určena všem těm, kteří chtějí získat stručný přehled o důležitých biomolekulách a metabolismu. Je tedy určena potenciálním studentům biologických oborů zabývajících se biodiverzitou, ekologií či taxonomií. Časový rozsah je nižší než v základní verzi přednášky a zkouška klade na studenta podstatně menší nároky.
Přednáška poskytuje přehled o základních typech biomolekul a hlavních segmentech buněčného metabolismu se zřetelem na energetiku heterotrofní buňky. Syllabus pokrývá stejnou látku jako přednáška Biochemie, rozdíl je v objemu přednášené látky. Je kladen menší důraz na chemické základy, reakční mechanismy, vyžaduje se znalost menšího počtu vzorců. Přibývá ilustrací vztahů molekulových a "vyšších" procesů. Přednáška ilustruje využití poznatků na molekulové úrovni k popisu a pochopení živé přírody. Informace o přednášce a studijní pomůcky je možno nalézt na stránce "Biochemie pro biology - Virtuální studovna biochemie" (//dl.cuni.cz), kde je také seznam literatury.

angličtina

Poslední úprava: PUTA (21.03.2006)

Please note, the lectures are given in czech language only.

Principles of Biochemistry is intended as a brief introduction for students who do not intend to specialize in the fields of Life Sciences.
Outline in brief : Biomolecules and the physicochemical principles of molecular interactions - water, amino acids, peptides, proteins, sugars, polysaccharides, lipids. Proteins, structure and function - three dimensional structure of proteins, protein folding, oxygen binding proteins, enzymes, enzymatic catalysis. Metabolism - glycolysis and glycogen metabolism, the citric acid cycle, oxidative phosphorylation and electron transport, lipid metabolism, amino acid metabolism, nucleotide metabolism, metabolism of other bioactive compounds, integration and organ specialization. Regulation of metabolic pathways at the cellular level- regulatory circuits in the regulation of glycolysis and gluconeogenesis, glycogen metabolism, fatty acid metabolism. Biochemical reactions important in molecular and cellular physiology. D. Voet, J.G. Voet, Biochemistry, J.Wiley and Sons. Inc., 1995, ISBN 0-471-58651-X G.L. Zubay, W.W. Parson, D.E. Vance, Principles of Biochemistry, Wm.C. Brown Communications, Inc., 1994, ISBN 0-697-14275-2

Literatura

Poslední úprava: Mgr. Bc. Naděžda Brdičková, Ph.D. (10.04.2012)

1. Voet,D., Voet, J.G.: Biochemistry, 4th edition 2011 (ISBN 978-0470-57095-1), John Wiley and sons. Inc.

2. Nelson, D.L., Cox, M.M: Lehninger Principles of Biochemistry, 5th edition 2008, (ISBN 978-0-7167-7108-1), W. H. Freeman and Company, New York

3. Vodrážka, Z.: Biochemie, 2. vydání 1999, (ISBN 80-2000600-1), Academia Praha

Požadavky ke zkoušce

Poslední úprava: doc. RNDr. Petr Folk, CSc. (19.02.2012)

Předmět je hodnocen formou dvou písemných testů. V průběžném testu bude zařazena látka probíraná na prvních šesti přednáškách; v závěrečném testu bude posléze veškerá látka syllabu. Otázky budou zaměřeny na procvičení základních principů (disociace AK, enzymová kinetika) a na logické spojování získaných znalostí. Schéma bodového hodnocení testů a konkrétní příklady otázek jsou uvedeny na stránce věnované předmětu v systému MOODLE - http://dl1.cuni.cz (Virtuální studovna biochemie pro biology). K přihlášení se do "Studovny" je třeba mít platné heslo v CAS a vstupní klíč studenta, který je k dispozici u přednášejících.

Testy pro předmět základy biochemie jsou odlišné od testů pro předmět Biochemie (MB150P04); jednak pokrývají menší syllabus, jednak je kladen menší důraz na počítání příkladů a na aplikaci znalostí na příkladech.

Předtermíny testů nejsou z technických důvodů možné. První termín a první opravný termín vždy probíhají formou písemného testu. Druhý opravný termín je ústní a probíhá před komisí pedagogů.

Sylabus

čeština

Poslední úprava: PUTA (31.05.2005)

VODA

Vlastnosti vody důležité pro život, Kyseliny, zásady a pufry

AMINOKYSELINY

Aminokyseliny obsažené v proteinech, Vlastnosti aminokyselin

KOVALENTNÍ STRUKTURA PROTEINŮ

PROSTOROVÉ STRUKTURY PROTEINŮ

Sekundární struktury, Fibrilární proteiny, Terciální struktury, Globulární proteiny, Kvartérní stuktura

SKLÁDÁNÍ A DYNAMIKA PROTEINŮ, VÝVOJ STRUKTURY

Stabilita proteinů, Fosforylace proteinů, Evoluce proteinových struktur

HEMOGLOBIN

Myoglobin, Struktura a funkce Hb, Allosterická regulace

SACHARIDY

Monosacharidy, Polysacharidy, Glykoproteiny

LIPIDY A MEMBRÁNY

Mastné kyseliny a lipidy, Biomembrány, Lipoproteiny

ENZYMOLOGIE

Důležité reakční mechanismy, Regulace enzymové aktivity, Kinetika Michaelise a Mentenové, Inhibice, Katalytické mechanismy, Chymotrypsin

STUDIUM METABOLISMU

Metabolické dráhy, Oxidačně - redukční reakce

GLYKOLÝZA

Glykolytické reakce, Fermentace, Regulace glykolýzy, Metabolismus glykogenu

Regulace metabolismu glykogenu

Glykogenfosforylasa a glykogensynthasa, Bicyklické kaskády, Udržování hladiny glukosy v krvi, Stresové reakce

CITRÁTOVÝ CYKLUS

Historie objevu, Metabolické zdroje acetylkoenzymu A, Enzymy citrátového cyklu, Regulace citrátového cyklu, Amfibolická povaha citrátového cyklu

TRANSPORT ELEKTRONŮ A OXIDATIVNÍ FOSFORYLACE

Transport elektronů, Struktura a funkce komplexů I až IV, Oxidativní fosforylace, Struktura a funkce FoF1-ATPasy, Regulace tvorby ATP

DALŠÍ METABOLICKÉ DRÁHY SACHARIDŮ

Glukoneogeneze, Coriho cyklus, Pentosafosfátová dráha

METABOLISMUS LIPIDŮ

Trávení lipidů, absorpce a transport, Oxidace mastných kyselin, Ketonové látky, Biosyntéza mastných kyselin, Metabolismus fosfolipidů a glykolipidů

METABOLISMUS AMINOKYSELIN

Deaminace aminokyselin, Močovinový cyklus a jeho regulace, Aminokyseliny v roli biosyntetických prekursorů

METABOLISMUS NUKLEOTIDŮ

Chemická struktura nukleotidů, nukleosidů a bází, Syntéza purinových nukleotidů, Znovuvyužití purinů, Syntéza pyrimidinových ribonukleotidů, Tvorba deoxyribonukleotidů, Katabolismus purinů

INTEGRACE METABOLISMU A ORGÁNOVÉ SPECIALIZACE

angličtina

Poslední úprava: PUTA (31.05.2005)

Up-to-date english version of the syllabus is available upon request.