Metody biomedicínské antropologie II - MB110P92

• Anglický název: Methods of Biomedical Anthropology II
• Český název: Metody biomedicínské antropologie II
• Zajišťuje: Katedra antropologie a genetiky člověka (31-110)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2019
• Semestr: zimní
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
• Rozsah, examinace: zimní s.:1/3, Z+Zk [HT]
• Počet míst: 30
• Minimální obsazenost: 5
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: prof. RNDr. Jana Velemínská, Ph.D.
• Vyučující: prof. RNDr. Jana Velemínská, Ph.D.

Anotace

Poslední úprava: Mgr. Lenka Dupejová (05.03.2019)

Předmět Biomedicínská metodologie II navazuje na předmět Biomedicínská metodologie I. Jeho cílem je vybavit studenty biomedicínské antropologie metodologickými znalostmi pro hodnocení morfologie objektů od přímého měření probandů až po digitální měření dvojrozměrných dat včetně jejich zpracování metodami klasické i geometrické morfometrie. Předmět je zaměřen na výuku metod, které analyzují hlavu od jeho vnějších oblastí až po vnitřní struktury, zaznamenávané nejčastěji pomocí RTG snímků, ale umožňující hodnotit také fotodokumentaci, výstupy PC tomografu či magnetické rezonance. Prvním cílem je zvládnout metodiku klasického měření hlavy, popř. jejich modelů v paměti počítače, včetně výpočtu proporčních indexů či základního zpracování dat metodami multivariační statistiky. Dalším cílem je představit a zároveň osvojit si vyhodnocování nejčastěji využívané zobrazovací techniky v medicíně. Studenti se naučí metricky vyhodnocovat dálkové RTG snímky hlavy pomocí speciálních softwarů, vyhodnocovat dentální věk dětí na základě analýzy panoramatických snímků a biologický věk dětí za použití RTG snímků ruky. Posledním cílem je představit metody geometrické morfometrie, včetně softwarů pro akvizici a statistické zpracování dvoj- a trojrozměrných dat. Z tohoto hlediska na předmět dále úzce navazuje kurz 3D metod aplikovaných v antropologii.

Literatura

Poslední úprava: Mgr. Lenka Dupejová (05.03.2019)

BOOKSTEIN F. L, 1992. Morphometric Tools for Landmark Data. Cambridge University Press.

SLICE, D. E., 2005. Modern Morphometrics in Physical Antropology. Kluwer Academic / Plenum Publisher, New York.

ZELDICH, M. L., SWIDERSKI, DL, SHEETS, HD., FINK, WL., 2004. Geometric Morphometrics for Biologists: a Primer. Elsvier Academic Press, New York.

ZIMA J., MACHOLÁN M. Analýza fenotypu In: Zima J., Machlán M. Munclinger P., Piálek J., 2004. Genetické metody v zoologii. Karolínum, Praha, str. 9-49.

HILLSON, S., Dental Anthropology. Cambridge University Press.

HAUSPIE C. R., CAMERON, N., MOLINARI, L. (2004): Methods in Human Growth Research. Cambridge University Press, Cambridge.

Požadavky ke zkoušce

Poslední úprava: Mgr. Lenka Dupejová (05.03.2019)

Zápočet se uděluje za odevzdaný protokol (kefalometrická analýza 3 RTG snímků hlavy, odhad věku na základě panoramatických snímků chrupu 3 jedinců, laboratorní zpracování dat metodami geometrické morfometrie).

Zkouška probíhá formou písemného testu.

Sylabus

Poslední úprava: doc. RNDr. Petr Sedlak, Ph.D. (12.10.2020)

Výuka v ZS 2020/21 bude zahájena začátkem listopadu. Přihlášení studenti včas obdrží informce o online přístupu.

 

1, Úvod do problematiky, zobrazovací metody v medicíně a antropologii.

2) Základy rentgenometrie, kefalometrická analýza laterálních RTG snímků.

3) Zadávání kefalometrických bodů a linií na RTG snímcích, praktická část.

4) Metrická analýza laterálních RTG snímků, využití softwarů SigmaScan, Craniometrics, Past, praktická část.

5) Odhad dentálního věku na základě panoramatických RTG snímků.

6) Odhad biologického věku na základě odečítání RTG snímků ruky.

7) Metody geometrické morfometrie: Úvod, Landmarkové metody, Úvod do lineární algebry, Dvoubodová registrace

8) Metody geometrické morfometrie: Prokrustovská analýza, Teorie tvaru, TPS

9, Metody geometrické morfometrie: Warps, FESA, PCA – výpočet a aplikace

10) Metody geometrické morfometrie: Nelandmarkové metody,

Semilandmarky, Integrální transformace, GM na povrchových modelech

11) Metody geometrické morfometrie: Statistika v kostce, Statistické testy,

Regresní analýza, Klasifikace

12) zápočet