Předmět je zakončen ústní zkouškou. Otázky, které jsou u zkoušky pokládány, čerpají z témat, uvedených v sylabu předmětu, a to v rozsahu, v němž jsou tato témata probírána na přednášce.

The course is concluded with an oral exam. Questions posed in the exam explore the topics included in the syllabus to the extent that these topics are covered in lectures.

M. Crochemore, C. Hancart, T. Lecroq, Algorithms on Strings, Cambridge University Press, 2014.

M. Crochemore, T. Lecroq, W. Rytter, 
125 Problems in Text Algorithms, 
Cambridge University Press, 2021

G. Navarro, M. Raffinot, Flexible Pattern Matching in Strings: Practical On-Line Search Algorithms for Texts and Biological Sequences, Cambridge University Press, 2007.

W. Smyth, Computing Patterns in Strings, Addison Wesley, 2003.

M. Crochemore, C. Hancart, T. Lecroq, Algorithms on Strings, Cambridge University Press, 2014.

M. Crochemore, T. Lecroq, W. Rytter, 
125 Problems in Text Algorithms, 
Cambridge University Press, 2021.

G. Navarro, M. Raffinot, Flexible Pattern Matching in Strings: Practical On-Line Search Algorithms for Texts and Biological Sequences, Cambridge University Press, 2007.

W. Smyth, Computing Patterns in Strings, Addison Wesley, 2003.

Úvod do stringologie

Datové struktury: sufixový strom a jeho varianty, sufixové pole, sufixové automaty

Přesné a přibližné vyhledávání vzorků v textu

Určování vzdálenosti slov a problém nejdelší společné podposloupnosti

Vyhledávání podle regulárních výrazů

Aplikace v bioinformatice a kompresi dat

Introduction to string algorithms

Data structures: suffix tree and its variants, suffix array, suffix automata

Exact and approximate pattern matching

String distance and the longest common subsequence

Regular expression matching

Applications in bioinformatics and data compression

Knowledge at the level of the subjects Algorithms and Data Structures I and II, Automata and Grammars.