Methods of Biomedical Anthropology II - MB110P92

• Title: Metody biomedicínské antropologie II
• Czech title: Metody biomedicínské antropologie II
• Guaranteed by: Department of Anthropology and Human Genetics (31-110)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2019
• Semester: winter
• E-Credits: 3
• Examination process: winter s.:
• Hours per week, examination: winter s.:1/3, C+Ex [HT]
• Capacity: 30
• Min. number of students: 5
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Note: enabled for web enrollment
• Guarantor: prof. RNDr. Jana Velemínská, Ph.D.
• Teacher(s): prof. RNDr. Jana Velemínská, Ph.D.

Annotation

Last update: Mgr. Lenka Dupejová (05.03.2019)

Předmět Biomedicínská metodologie II navazuje na předmět Biomedicínská metodologie I. Jeho cílem je vybavit studenty biomedicínské antropologie metodologickými znalostmi pro hodnocení morfologie objektů od přímého měření probandů až po digitální měření dvojrozměrných dat včetně jejich zpracování metodami klasické i geometrické morfometrie. Předmět je zaměřen na výuku metod, které analyzují hlavu od jeho vnějších oblastí až po vnitřní struktury, zaznamenávané nejčastěji pomocí RTG snímků, ale umožňující hodnotit také fotodokumentaci, výstupy PC tomografu či magnetické rezonance. Prvním cílem je zvládnout metodiku klasického měření hlavy, popř. jejich modelů v paměti počítače, včetně výpočtu proporčních indexů či základního zpracování dat metodami multivariační statistiky. Dalším cílem je představit a zároveň osvojit si vyhodnocování nejčastěji využívané zobrazovací techniky v medicíně. Studenti se naučí metricky vyhodnocovat dálkové RTG snímky hlavy pomocí speciálních softwarů, vyhodnocovat dentální věk dětí na základě analýzy panoramatických snímků a biologický věk dětí za použití RTG snímků ruky. Posledním cílem je představit metody geometrické morfometrie, včetně softwarů pro akvizici a statistické zpracování dvoj- a trojrozměrných dat. Z tohoto hlediska na předmět dále úzce navazuje kurz 3D metod aplikovaných v antropologii.

Literature

Last update: Mgr. Lenka Dupejová (05.03.2019)

BOOKSTEIN F. L, 1992. Morphometric Tools for Landmark Data. Cambridge University Press.

SLICE, D. E., 2005. Modern Morphometrics in Physical Antropology. Kluwer Academic / Plenum Publisher, New York.

ZELDICH, M. L., SWIDERSKI, DL, SHEETS, HD., FINK, WL., 2004. Geometric Morphometrics for Biologists: a Primer. Elsvier Academic Press, New York.

ZIMA J., MACHOLÁN M. Analýza fenotypu In: Zima J., Machlán M. Munclinger P., Piálek J., 2004. Genetické metody v zoologii. Karolínum, Praha, str. 9-49.

HILLSON, S., Dental Anthropology. Cambridge University Press.

HAUSPIE C. R., CAMERON, N., MOLINARI, L. (2004): Methods in Human Growth Research. Cambridge University Press, Cambridge.

Requirements to the exam

Last update: Mgr. Lenka Dupejová (05.03.2019)

Zápočet se uděluje za odevzdaný protokol (kefalometrická analýza 3 RTG snímků hlavy, odhad věku na základě panoramatických snímků chrupu 3 jedinců, laboratorní zpracování dat metodami geometrické morfometrie).

Zkouška probíhá formou písemného testu.

Syllabus

Last update: doc. RNDr. Petr Sedlak, Ph.D. (12.10.2020)

Výuka v ZS 2020/21 bude zahájena začátkem listopadu. Přihlášení studenti včas obdrží informce o online přístupu.

 

1, Úvod do problematiky, zobrazovací metody v medicíně a antropologii.

2) Základy rentgenometrie, kefalometrická analýza laterálních RTG snímků.

3) Zadávání kefalometrických bodů a linií na RTG snímcích, praktická část.

4) Metrická analýza laterálních RTG snímků, využití softwarů SigmaScan, Craniometrics, Past, praktická část.

5) Odhad dentálního věku na základě panoramatických RTG snímků.

6) Odhad biologického věku na základě odečítání RTG snímků ruky.

7) Metody geometrické morfometrie: Úvod, Landmarkové metody, Úvod do lineární algebry, Dvoubodová registrace

8) Metody geometrické morfometrie: Prokrustovská analýza, Teorie tvaru, TPS

9, Metody geometrické morfometrie: Warps, FESA, PCA – výpočet a aplikace

10) Metody geometrické morfometrie: Nelandmarkové metody,

Semilandmarky, Integrální transformace, GM na povrchových modelech

11) Metody geometrické morfometrie: Statistika v kostce, Statistické testy,

Regresní analýza, Klasifikace

12) zápočet