Organ segmentation
| Thesis title in Czech: | Segmentace orgánů |
|---|---|
| Thesis title in English: | Organ segmentation |
| Key words: | objemová data, segmentace, active contours, parametric snakes, měření objemu, optimalizace, medicínské zobrazování, B-spline křivky |
| English key words: | volumetric data, segmentation, active contours, parametric snakes, volume measurement, optimization, medical imaging, B-splines |
| Academic year of topic announcement: | 2013/2014 |
| Thesis type: | rigorosum thesis |
| Thesis language: | angličtina |
| Department: | Department of Software and Computer Science Education (32-KSVI) |
| Supervisor: | |
| Author: | hidden - assigned and confirmed by the Study Dept. |
| Date of registration: | 03.07.2014 |
| Date of assignment: | 03.07.2014 |
| Confirmed by Study dept. on: | 03.07.2014 |
| Date and time of defence: | 23.09.2014 00:00 |
| Date of electronic submission: | 03.07.2014 |
| Date of submission of printed version: | 03.07.2014 |
| Date of proceeded defence: | 23.09.2014 |
| Guidelines |
| Práce navazuje na diplomovou práci Václava Krajíčka obhájenou v r. 2007. Byly navrženy a vyzkoušeny algoritmy na segmentaci a měření objemu orgánů, uspokojivě pracují na ledvinách a slezině. Použité přístupy: active contours, reprezentace křivek pomocí B-spline (postup po jednotlivých řezech) nebo celého orgánu najednou ve 3D (B-spline plochy).
Úkolem diplomanta bude podrobně prostudovat problematiku segmentace včetně přístupů a výsledkú Václava Krajíčka. Prvním úkolem bude přenést tyto algoritmy do prostředí MedV4D a připravit je k praktickému použití lékařem. Další vývoj se bude koordinovat přímo s výzkumem pana Krajíčka, je třeba si vybrat jedno rozšiřující téma: masivnější paralelizace výpočtu (shared memory, distributed computing), vylepšování práce segmentačních metod, zkoumání možnosti použití textur pro lepší identifikaci vnitřku orgánu, doladění postupu na topologicky složitějších orgánech (játra). Dosažené výsledky by měly být prakticky použitelné v lékařské praxi, vytvořené programy je potřeba dobře dokumentovat. |
| References |
| 1. Rafael C. Gonzalez, Richard E. Woods: Digital Image Processing (3rd Edition), Prentice Hall, 2007
2. Václav Krajíček: Volume measurement in 3D data, Diploma thesis, MFF UK, 2007 3. Message Passing Interface Forum. MPI-2: Extensions to the Message-Passing Interface. 15 Nov 2003, on-line version: http://www.mpi-forum.org/ 4. Dokumentace projektu MedV4D |